More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2031 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  98.31 
 
 		 472 aa  912    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  100 
 
 		 472 aa  925    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  67.53 
 
 		 503 aa  610  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  62.34 
 
 		 485 aa  586  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  62.58 
 
 		 485 aa  586  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  57.05 
 
 		 511 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  57.05 
 
 		 511 aa  556  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  57.05 
 
 		 511 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  57.05 
 
 		 511 aa  556  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  57.26 
 
 		 511 aa  556  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  57.05 
 
 		 511 aa  556  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  57.05 
 
 		 511 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  57.05 
 
 		 511 aa  556  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  57.05 
 
 		 511 aa  556  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0148  amino acid permease-associated region  58.42 
 
 		 720 aa  504  1e-141  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  43.46 
 
 		 511 aa  397  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  37.47 
 
 		 473 aa  333  4e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  38.38 
 
 		 494 aa  332  1e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  34.5 
 
 		 494 aa  265  1e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  31.75 
 
 		 480 aa  242  1e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  29.87 
 
 		 467 aa  231  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  29.87 
 
 		 467 aa  229  8e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  31.09 
 
 		 464 aa  222  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  31.09 
 
 		 464 aa  222  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  29.34 
 
 		 474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  30.24 
 
 		 474 aa  219  6e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  30.24 
 
 		 474 aa  219  8.999999999999998e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  30.36 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  33.82 
 
 		 508 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  32.43 
 
 		 499 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  30.66 
 
 		 473 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  30.66 
 
 		 473 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  30.37 
 
 		 490 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  28.13 
 
 		 495 aa  204  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  32.57 
 
 		 495 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  30 
 
 		 506 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  29.79 
 
 		 506 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  29.11 
 
 		 469 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  30.11 
 
 		 475 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  24.73 
 
 		 470 aa  180  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  24.73 
 
 		 476 aa  179  7e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  29.21 
 
 		 475 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  24.84 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  24.63 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  24.84 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  24.84 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  24.84 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0217  amino acid antiporter  31.46 
 
 		 782 aa  144  3e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  25.4 
 
 		 472 aa  132  9e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1629  hypothetical protein  26.55 
 
 		 445 aa  127  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1623  hypothetical protein  26.3 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  24.81 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  24.56 
 
 		 495 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  24.81 
 
 		 489 aa  94.7  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000367074  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002656  putative oxidoreductase  23.85 
 
 		 477 aa  94.4  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  23.85 
 
 		 489 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1382  amino acid permease-associated region  23.29 
 
 		 501 aa  90.9  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.320464  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 		 455 aa  90.9  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 500 aa  88.6  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3545  amino acid permease family protein  22.94 
 
 		 477 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4392  amino acid permease family protein  22.94 
 
 		 477 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3260  amino acid permease family protein  22.94 
 
 		 477 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02947  predicted transporter  22.63 
 
 		 477 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3372  amino acid permease family protein  22.94 
 
 		 477 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0622  amino acid permease-associated region  22.63 
 
 		 477 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5674  amino acid permease family protein  24.04 
 
 		 514 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270283  normal  0.215143 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04028  predicted transporter  24.04 
 
 		 500 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.853032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03990  hypothetical protein  24.04 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.826607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0623  amino acid permease-associated region  22.4 
 
 		 477 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4715  amino acid permease family protein  24.16 
 
 		 500 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.212622  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4627  amino acid permease family protein  24.52 
 
 		 514 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.592733  normal  0.0531629 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3854  amino acid permease-associated region  24.04 
 
 		 500 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1400  amino acid permease family protein  26.2 
 
 		 498 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00116878  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1212  amino acid permease yshA  25.51 
 
 		 498 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0367716  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4400  amino acid permease family protein  24.04 
 
 		 500 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1975  amino acid permease-associated region  24.01 
 
 		 496 aa  83.2  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0141312 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3834  amino acid permease-associated region  23.83 
 
 		 514 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  23.54 
 
 		 500 aa  82  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  0.0000196904 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  22.44 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  24.13 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1226  amino acid permease-associated region  25.76 
 
 		 497 aa  79.7  0.00000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0828  amino acid transporter  23.55 
 
 		 502 aa  79  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000137053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03339  hypothetical protein  23.2 
 
 		 476 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0808  putrescine transporter  24.52 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.210181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0821  putrescine transporter  24.52 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.438039  normal  0.147845 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0857  putrescine transporter  24.52 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0747  putrescine transporter  24.52 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110662  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0760  putrescine transporter  24.52 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.428261  normal  0.419082 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5194  putrescine transporter  23.71 
 
 		 452 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1082  inner membrane transporter YcaM  23.47 
 
 		 473 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4706  inner membrane transporter YjeM  23.39 
 
 		 500 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.929482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1033  inner membrane transporter YcaM  23.47 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.843228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1067  inner membrane transporter YcaM  23.47 
 
 		 473 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.154382  normal  0.709783 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0973  inner membrane transporter YcaM  23.47 
 
 		 473 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1002  inner membrane transporter YcaM  23.47 
 
 		 473 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4763  inner membrane transporter YjeM  23.39 
 
 		 500 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.520052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1005  amino acid permease family protein  22.7 
 
 		 540 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0976  amino acid permease family protein  22.7 
 
 		 540 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.953218  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4623  inner membrane transporter YjeM  23.39 
 
 		 500 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4615  inner membrane transporter YjeM  23.39 
 
 		 500 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>