73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2789 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2475  stage II sprulation protein E, putative  96.36 
 
 		 796 aa  1496    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.461942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2789  stage II sporulation protein E  100 
 
 		 796 aa  1592    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0790  phosphoprotein phosphatase  29.77 
 
 		 781 aa  340  5e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2681  serine phosphatase  27.6 
 
 		 798 aa  339  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2986  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  28.05 
 
 		 804 aa  314  4.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.948588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0124  phosphoprotein phosphatase  27.57 
 
 		 824 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0195  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  25.71 
 
 		 821 aa  280  6e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0057  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  24.44 
 
 		 826 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0059  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  25.53 
 
 		 826 aa  263  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00270426  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0085  phosphoprotein phosphatase  26.56 
 
 		 806 aa  250  6e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0093  phosphoprotein phosphatase  25.44 
 
 		 824 aa  249  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5247  stage II sporulation protein E  24.51 
 
 		 823 aa  248  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0104377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0073  stage II sporulation protein E  24.51 
 
 		 823 aa  248  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00108149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0057  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  24.16 
 
 		 823 aa  248  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0060  stage II sporulation protein E  24.51 
 
 		 792 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00425059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0069  stage II sporulation protein E  24.51 
 
 		 823 aa  247  6e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00552781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0057  serine/threonine specific protein phosphatase; stage II sporulation protein E  24.38 
 
 		 792 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0057  serine/threonine specific protein phosphatase; stage II sporulation protein E  24.38 
 
 		 808 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0061  stage II sporulation protein E  24.38 
 
 		 808 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0061  stage II sporulation protein E  24.38 
 
 		 792 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000183348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0070  stage II sporulation protein E  24.38 
 
 		 823 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0057  sporulation stage II protein E  25.19 
 
 		 815 aa  242  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234596  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2061  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  25.29 
 
 		 792 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0227  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  25.32 
 
 		 851 aa  238  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0078  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  26.12 
 
 		 833 aa  217  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00550  Serine/threonine specific protein phosphatase spoIIE  24.68 
 
 		 790 aa  214  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00773403  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0138  protein serine/threonine phosphatase  26.24 
 
 		 527 aa  172  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.32132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0217  protein serine/threonine phosphatase  25.76 
 
 		 764 aa  152  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0103  serine phosphatase  29.95 
 
 		 680 aa  147  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0143  protein serine/threonine phosphatase  30.71 
 
 		 697 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000162772  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0393  putative GAF sensor protein  29.27 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667086  normal  0.648976 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0414  putative GAF sensor protein  29.27 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.479373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0405  serine phosphatase  29.27 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  23.91 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  27.14 
 
 		 464 aa  57  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3698  Stage II sporulation E family protein  24.66 
 
 		 570 aa  55.1  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1283  protein serine/threonine phosphatase  26.54 
 
 		 235 aa  54.7  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00412718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2194  Stage II sporulation E family protein  29.03 
 
 		 423 aa  52.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  22.93 
 
 		 400 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1584  stage II sporulation E family protein  25.11 
 
 		 383 aa  52  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00248045  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02070  Stage II sporulation E family protein  26.15 
 
 		 384 aa  51.6  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3451  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:stage II sporulation E  28.37 
 
 		 568 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0112  protein serine/threonine phosphatase  23.18 
 
 		 251 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.193496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.15 
 
 		 606 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3860  protein serine/threonine phosphatase  26.4 
 
 		 393 aa  50.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5033  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.56 
 
 		 389 aa  49.3  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  18.51 
 
 		 516 aa  48.9  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.75 
 
 		 391 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  24.77 
 
 		 453 aa  48.5  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2489  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase and phosphatase)  21.86 
 
 		 330 aa  48.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4565  stage II sporulation E family protein  25.34 
 
 		 252 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.446834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5306  protein serine/threonine phosphatase  25.23 
 
 		 715 aa  47.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4365  protein serine/threonine phosphatase  24.54 
 
 		 405 aa  47.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2104  stage II sporulation E family protein  23.98 
 
 		 333 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.799939  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0442  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.31 
 
 		 421 aa  47  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723738  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2141  stage II sporulation E family protein  23.98 
 
 		 333 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  22.83 
 
 		 590 aa  46.6  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3700  serine phosphatase  23.97 
 
 		 385 aa  46.2  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  22.22 
 
 		 612 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  21.95 
 
 		 451 aa  46.6  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  24.55 
 
 		 488 aa  45.8  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  26.15 
 
 		 391 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  22.39 
 
 		 566 aa  45.4  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0435  response regulator receiver protein  23.79 
 
 		 373 aa  45.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  25 
 
 		 262 aa  45.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1964  response regulator  30.71 
 
 		 568 aa  44.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.58831  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 		 560 aa  44.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2299  protein serine/threonine phosphatase  25.36 
 
 		 390 aa  44.7  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.12742  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  23.66 
 
 		 418 aa  44.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1210  response regulator receiver protein  23.66 
 
 		 400 aa  44.3  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0544929  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  23.27 
 
 		 644 aa  44.3  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0056  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.17 
 
 		 418 aa  44.3  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.76 
 
 		 480 aa  44.3  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>