71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0077 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0099  rubrerythrin  98.89 
 
 		 180 aa  363  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0220347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2638  rubrerythrin  98.89 
 
 		 188 aa  363  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000156836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0077  rubredoxin/rubrerythrin  100 
 
 		 180 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.165154  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2955  rubredoxin/rubrerythrin  98.89 
 
 		 180 aa  363  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00806345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0682  rubredoxin/rubrerythrin  95.56 
 
 		 180 aa  349  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0681  rubredoxin/rubrerythrin  93.33 
 
 		 180 aa  346  9e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4567  Rubrerythrin  80.66 
 
 		 181 aa  300  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.02567e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0588  rubrerythrin  76.24 
 
 		 181 aa  291  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3505  rubrerythrin  76.11 
 
 		 180 aa  284  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000134331  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0081  rubrerythrin  69.83 
 
 		 181 aa  275  4e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0902  Rubrerythrin  72.38 
 
 		 181 aa  253  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197939  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3816  rubrerythrin  66.11 
 
 		 180 aa  248  5e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477508  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0954  rubrerythrin  55.8 
 
 		 140 aa  131  6e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1532  rubrerythrin  50 
 
 		 139 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0387  rubrerythrin  51.05 
 
 		 139 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.424409 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0449  rubrerythrin  51.05 
 
 		 139 aa  130  9e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1879  rubrerythrin  51.47 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000143668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15600  Rubrerythrin  45.83 
 
 		 141 aa  127  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0458  rubrerythrin  48.59 
 
 		 139 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.79007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2476  rubrerythrin  46.1 
 
 		 140 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000982174  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1108  Rubrerythrin  47.86 
 
 		 143 aa  108  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.666656  normal  0.376082 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2434  rubrerythrin  42.74 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1596  hypothetical protein  40.98 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2117  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  67.57 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0063  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34.34 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  28.88 
 
 		 696 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.91 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  29.79 
 
 		 696 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  63.33 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  31.9 
 
 		 392 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  69.7 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.39 
 
 		 520 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3241  hypothetical protein  61.76 
 
 		 36 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000312443  hitchhiker  0.0015976 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1529  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.65 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00138894  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.15 
 
 		 52 aa  47  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  27.82 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  69.57 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  37.04 
 
 		 884 aa  46.6  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  57.58 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2460  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase or nitrite reductase  55.17 
 
 		 501 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000440664  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  25.55 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  28.21 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1125  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.06 
 
 		 53 aa  44.7  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.228048  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  58.62 
 
 		 182 aa  44.7  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  38.16 
 
 		 166 aa  44.7  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  51.61 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  50 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  51.72 
 
 		 878 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0414  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.23 
 
 		 52 aa  44.3  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  24.82 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  51.72 
 
 		 878 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  28.93 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1856  ruberythrin-like  45.45 
 
 		 39 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406851  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  38.03 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2234  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.84 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000004842  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  56.25 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  57.58 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  27.54 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0436  hypothetical protein  51.52 
 
 		 802 aa  42.4  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  60.61 
 
 		 166 aa  42  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  35.62 
 
 		 164 aa  42  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  60.87 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  29.06 
 
 		 179 aa  41.6  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  60.87 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  29.46 
 
 		 140 aa  41.6  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  55.17 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  30.43 
 
 		 195 aa  41.2  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  30.43 
 
 		 195 aa  41.2  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  30.1 
 
 		 157 aa  41.2  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0014  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.78 
 
 		 52 aa  40.8  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.25088  normal  0.171003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  39.06 
 
 		 168 aa  40.8  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>