More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0896 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0896  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 429 aa  867    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.583722  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0770  glutamyl-tRNA reductase  57.8 
 
 		 435 aa  489  1e-137  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0764  glutamyl-tRNA reductase  60 
 
 		 428 aa  478  1e-133  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.014297  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1051  glutamyl-tRNA reductase  58.65 
 
 		 427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00451156  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0688  glutamyl-tRNA reductase  57.78 
 
 		 422 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0940243  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0646  glutamyl-tRNA reductase  55.2 
 
 		 432 aa  454  1e-127  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0567  glutamyl-tRNA reductase  55.43 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.232431  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1388  glutamyl-tRNA reductase  54.73 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1326  glutamyl-tRNA reductase  52.27 
 
 		 433 aa  411  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000214517  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0859  glutamyl-tRNA reductase  41.59 
 
 		 432 aa  339  5e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0924191  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  35.85 
 
 		 436 aa  247  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 443 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  35.01 
 
 		 434 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  35.14 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  34.91 
 
 		 434 aa  230  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  32.86 
 
 		 422 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  34.04 
 
 		 434 aa  227  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  33.87 
 
 		 434 aa  226  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  32.62 
 
 		 422 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  33.1 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  33.8 
 
 		 434 aa  223  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  32.23 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  31.99 
 
 		 425 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  31.28 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  31.28 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  31.52 
 
 		 425 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 421 aa  216  9e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  35.99 
 
 		 430 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  32.3 
 
 		 446 aa  212  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  32.37 
 
 		 425 aa  210  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  32.55 
 
 		 425 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  34.12 
 
 		 443 aa  208  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  31.72 
 
 		 464 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  32.31 
 
 		 425 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  31.62 
 
 		 420 aa  205  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  33.08 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  30.59 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  33.5 
 
 		 440 aa  205  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  32.72 
 
 		 441 aa  204  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  31.46 
 
 		 408 aa  203  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  33.67 
 
 		 450 aa  202  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  32.33 
 
 		 443 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  32.55 
 
 		 454 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  32.42 
 
 		 464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  31.92 
 
 		 440 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  32.39 
 
 		 465 aa  199  7e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  31.08 
 
 		 438 aa  199  9e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  31.42 
 
 		 432 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  31.38 
 
 		 422 aa  196  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  32.1 
 
 		 458 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  30.34 
 
 		 468 aa  196  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  30.42 
 
 		 425 aa  194  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  30.68 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  30.68 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  30.68 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  34.09 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  31.42 
 
 		 436 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  30.68 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  31 
 
 		 455 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.41 
 
 		 461 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  31.85 
 
 		 456 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  31.5 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  28.97 
 
 		 451 aa  189  8e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  31.53 
 
 		 446 aa  189  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  30.89 
 
 		 436 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  30.18 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  31.68 
 
 		 449 aa  187  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0776  glutamyl-tRNA reductase  31.75 
 
 		 436 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  31.7 
 
 		 442 aa  187  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  30.84 
 
 		 434 aa  186  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  31.84 
 
 		 436 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  30.73 
 
 		 444 aa  186  9e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  30.96 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  30.96 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  30.96 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  30.96 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  30.96 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  30.28 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  30.5 
 
 		 444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  30.54 
 
 		 444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  31.25 
 
 		 427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  32.05 
 
 		 432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  30.52 
 
 		 443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  30.54 
 
 		 444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  30.29 
 
 		 416 aa  184  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  32.39 
 
 		 446 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  29.43 
 
 		 429 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  31.03 
 
 		 448 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  31.46 
 
 		 438 aa  184  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08151  glutamyl-tRNA reductase  30.91 
 
 		 435 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.374123  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  30.53 
 
 		 428 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  30.53 
 
 		 428 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  29.09 
 
 		 435 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  30.26 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  30.26 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  30.73 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  29.38 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  30.5 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  28.51 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>