More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0042 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1163  NifS family cysteine desulfurase  76.77 
 
 
396 aa  639  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1696  cysteine desulfurase  76.52 
 
 
396 aa  640  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0042  NifS family cysteine desulfurase  100 
 
 
396 aa  810  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1770  NifS family cysteine desulfurase  75.25 
 
 
396 aa  630  1e-179  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.406981  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0265  cysteine desulfurase, putative  69.72 
 
 
393 aa  574  1e-163  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1486  cysteine desulfurase/aminotransferase, IscS/NifS family  70.51 
 
 
392 aa  577  1e-163  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0238  putative cysteine desulfurase  69.47 
 
 
393 aa  574  1e-162  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0291  cysteine desulfurase  69.21 
 
 
393 aa  572  1e-162  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  66.67 
 
 
396 aa  564  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2008  aminotransferase, class V  62.95 
 
 
404 aa  504  1e-141  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.475663  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  46.72 
 
 
402 aa  352  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  46.19 
 
 
396 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.14 
 
 
404 aa  348  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  46.34 
 
 
400 aa  343  3e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.19 
 
 
400 aa  343  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  44.09 
 
 
393 aa  341  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  46.46 
 
 
394 aa  338  9e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  44.62 
 
 
389 aa  338  1e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  45.67 
 
 
404 aa  337  3e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  46.46 
 
 
400 aa  336  4e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  43.78 
 
 
402 aa  332  9e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  44.97 
 
 
379 aa  330  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  44.88 
 
 
389 aa  330  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  44.62 
 
 
402 aa  329  6e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  44.62 
 
 
389 aa  328  1e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  44.62 
 
 
384 aa  328  1e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  43.04 
 
 
391 aa  327  2e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  45.19 
 
 
392 aa  327  2e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  45.24 
 
 
400 aa  327  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  43.31 
 
 
388 aa  327  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  44.88 
 
 
407 aa  326  4e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  44.53 
 
 
400 aa  325  7e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  43.34 
 
 
391 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  44.65 
 
 
384 aa  324  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  45.29 
 
 
384 aa  323  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  44.62 
 
 
401 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  44.62 
 
 
401 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  43.57 
 
 
402 aa  322  8e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.93 
 
 
398 aa  322  9e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  41.25 
 
 
391 aa  319  4e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  42.01 
 
 
396 aa  319  6e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.40569e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  43.42 
 
 
397 aa  318  7e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  9.44956e-06 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  43.49 
 
 
399 aa  319  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  43.8 
 
 
403 aa  318  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  43.83 
 
 
401 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  43.91 
 
 
398 aa  315  8e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  43.29 
 
 
405 aa  315  9e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  43.38 
 
 
398 aa  315  1e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  42.6 
 
 
398 aa  314  2e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  42.6 
 
 
398 aa  314  2e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  44.62 
 
 
386 aa  310  2e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  42.15 
 
 
414 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  5.61511e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  43.34 
 
 
382 aa  310  3e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  41.93 
 
 
394 aa  308  9e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  44.76 
 
 
400 aa  308  2e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  42.26 
 
 
399 aa  306  3e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  42.97 
 
 
387 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  42.08 
 
 
396 aa  306  5e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  42.39 
 
 
417 aa  305  1e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  41.67 
 
 
388 aa  304  2e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  41.79 
 
 
394 aa  303  4e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.84465e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  41.41 
 
 
387 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  41.33 
 
 
404 aa  301  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  41.09 
 
 
398 aa  300  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.01074e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  42.67 
 
 
397 aa  299  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  40.79 
 
 
393 aa  298  1e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  42.41 
 
 
388 aa  298  1e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  45.41 
 
 
394 aa  297  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  42.3 
 
 
380 aa  296  6e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  43.96 
 
 
404 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  40.42 
 
 
389 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  40.56 
 
 
405 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  41.73 
 
 
407 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  40.82 
 
 
405 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  40.82 
 
 
405 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  40.56 
 
 
405 aa  290  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  43.57 
 
 
404 aa  290  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  41.62 
 
 
407 aa  289  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  41.07 
 
 
407 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  40.62 
 
 
392 aa  288  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  40.82 
 
 
407 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  41.48 
 
 
407 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  40.82 
 
 
407 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  40.78 
 
 
396 aa  288  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  40.82 
 
 
407 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  40.82 
 
 
407 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  40.82 
 
 
407 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  40.82 
 
 
407 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  41.99 
 
 
388 aa  286  4e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  42.27 
 
 
383 aa  285  7e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  41.11 
 
 
373 aa  285  1e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  40.31 
 
 
407 aa  285  1e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  40.31 
 
 
407 aa  285  1e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  40.58 
 
 
384 aa  284  2e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  42.24 
 
 
405 aa  284  2e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  7.72731e-05  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  39.42 
 
 
394 aa  283  3e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  40.56 
 
 
407 aa  283  3e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  40.05 
 
 
407 aa  283  3e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  40.56 
 
 
407 aa  283  3e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  39.54 
 
 
406 aa  283  3e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>