173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0206 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 
449 aa  924    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  39.62 
 
 
465 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  28.91 
 
 
490 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  32.89 
 
 
449 aa  208  1e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  30.65 
 
 
457 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  30.55 
 
 
453 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  30.99 
 
 
500 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  30.26 
 
 
462 aa  196  8.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  32.52 
 
 
462 aa  189  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  30.34 
 
 
446 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  32.06 
 
 
446 aa  187  3e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  30.11 
 
 
446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  29.1 
 
 
463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  27.87 
 
 
457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  32.2 
 
 
451 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  29.74 
 
 
450 aa  176  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  29.66 
 
 
453 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  28.47 
 
 
456 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4268  MmgE/PrpD family protein  31.5 
 
 
454 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  26.59 
 
 
451 aa  170  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  29.05 
 
 
461 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  29.38 
 
 
463 aa  168  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  28.47 
 
 
451 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  28.67 
 
 
481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  28.64 
 
 
476 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  31.19 
 
 
453 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  29 
 
 
482 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  27.66 
 
 
471 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  28.19 
 
 
483 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  30.45 
 
 
450 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  29.47 
 
 
451 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  29.37 
 
 
451 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  26.47 
 
 
455 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  26.89 
 
 
501 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  27.05 
 
 
441 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  28.39 
 
 
456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  26.7 
 
 
488 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  30.81 
 
 
456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  26.57 
 
 
450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  26.57 
 
 
450 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  25.91 
 
 
441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  27.62 
 
 
472 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  30.12 
 
 
458 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  27.17 
 
 
468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  26.98 
 
 
457 aa  137  5e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  29.5 
 
 
503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  29.5 
 
 
503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  27.03 
 
 
460 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  28.27 
 
 
453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  28.24 
 
 
450 aa  133  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  27.66 
 
 
458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  26.58 
 
 
486 aa  131  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  27.06 
 
 
460 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0108  propionate catabolism protein  25.87 
 
 
444 aa  130  5.0000000000000004e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  28.44 
 
 
456 aa  130  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  27.42 
 
 
461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  23.57 
 
 
467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  31.16 
 
 
468 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  27.42 
 
 
458 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  26.88 
 
 
449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2365  MmgE/PrpD family protein  32.42 
 
 
439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  25.88 
 
 
458 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  25.12 
 
 
481 aa  127  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  24.28 
 
 
449 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  27.7 
 
 
503 aa  126  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  26.1 
 
 
482 aa  126  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3745  MmgE/PrpD family protein  32.13 
 
 
442 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  25.6 
 
 
460 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  26.61 
 
 
461 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0638  MmgE/PrpD family protein  29.33 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  26.68 
 
 
454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  26.23 
 
 
481 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  25.17 
 
 
457 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  26.79 
 
 
447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  26.2 
 
 
442 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  23.18 
 
 
469 aa  119  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  28.83 
 
 
465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  25.93 
 
 
494 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  25.86 
 
 
463 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  25.54 
 
 
464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  26.08 
 
 
445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  23.8 
 
 
472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  25.17 
 
 
462 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3559  MmgE/PrpD family protein  30.45 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.595946  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  22.84 
 
 
489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  24.09 
 
 
474 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  26.86 
 
 
453 aa  111  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  24.06 
 
 
491 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  24.06 
 
 
491 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  24.06 
 
 
491 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  25.89 
 
 
458 aa  110  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  24.12 
 
 
487 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  25.69 
 
 
461 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  27.39 
 
 
447 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  24.01 
 
 
492 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2001  2-methylcitrate dehydratase  25.67 
 
 
449 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  24.01 
 
 
492 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  24.01 
 
 
492 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  24.01 
 
 
492 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  23.46 
 
 
453 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>