53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0041 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0041  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
460 aa  929  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.294388  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1372  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.83 
 
 
480 aa  514  1e-145  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1247  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.03 
 
 
437 aa  325  1e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0824  endonuclease/exonuclease/phosphatase, putative  37.69 
 
 
431 aa  262  1e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0502024  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.1 
 
 
334 aa  131  2e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1506  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.18 
 
 
310 aa  117  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0135963  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1027  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.85 
 
 
347 aa  91.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0904827  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04510  hypothetical protein  29.64 
 
 
324 aa  84.7  3e-15  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1180  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.75 
 
 
347 aa  67  6e-10  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.494829  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0605  hypothetical protein  24.46 
 
 
413 aa  65.1  3e-09  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.662935 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1377  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.68 
 
 
325 aa  62.4  2e-08  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1186  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.94 
 
 
342 aa  60.8  5e-08  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0946  hypothetical protein  28.29 
 
 
342 aa  60.5  6e-08  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1196  hypothetical protein  25 
 
 
348 aa  60.5  6e-08  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0006  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.18 
 
 
499 aa  60.1  9e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113565  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2587  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.15 
 
 
339 aa  58.5  2e-07  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.140684  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.93 
 
 
942 aa  57.4  5e-07  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.11243e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1119  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.62 
 
 
348 aa  55.8  2e-06  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.64 
 
 
341 aa  54.7  3e-06  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1431  hypothetical protein  22.44 
 
 
331 aa  54.3  4e-06  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  26.79 
 
 
1346 aa  53.9  6e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1000  hypothetical protein  24.84 
 
 
1076 aa  52.4  2e-05  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.73 
 
 
945 aa  51.2  4e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.42 
 
 
848 aa  50.8  5e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.09 
 
 
818 aa  50.1  8e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0267  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.02 
 
 
291 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0340  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.02 
 
 
291 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.8 
 
 
826 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01980  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.99 
 
 
286 aa  47.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.496471  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2783  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.64 
 
 
313 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0990816  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.44 
 
 
940 aa  47.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  9.62851e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3704  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.7 
 
 
322 aa  47.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  22.26 
 
 
948 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2849  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.58 
 
 
276 aa  47  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.942011  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.96 
 
 
601 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2753  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.04 
 
 
296 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.83 
 
 
947 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0051  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.8 
 
 
292 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.171004 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.91 
 
 
1641 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1220  hypothetical protein  21.51 
 
 
363 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133242  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.31 
 
 
573 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.79 
 
 
955 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  22.26 
 
 
948 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5100  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.35 
 
 
284 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0779207 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2847  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.61 
 
 
296 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.453576  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5836  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.08 
 
 
592 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  21.55 
 
 
948 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.86 
 
 
1075 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  22.34 
 
 
948 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1980  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.45 
 
 
301 aa  43.9  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.244813  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.36 
 
 
944 aa  43.9  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02630  hypothetical protein  25.37 
 
 
359 aa  43.9  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.249483  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  22.14 
 
 
780 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>