More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1315 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0468  UvrD/REP helicase  38.52 
 
 		 1134 aa  691    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1975  UvrD/REP helicase  38.12 
 
 		 1132 aa  761    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.109081  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0988  UvrD/REP helicase  41.79 
 
 		 1146 aa  832    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181635  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1708  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  41.68 
 
 		 1118 aa  850    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  99.64 
 
 		 1110 aa  2265    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1697  UvrD/REP helicase  36.21 
 
 		 1182 aa  639    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0723  UvrD/REP helicase  39.7 
 
 		 1196 aa  815    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1751  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  37.25 
 
 		 1129 aa  655    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.910924 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3622  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  37.03 
 
 		 1135 aa  666    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  100 
 
 		 1110 aa  2274    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0973  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  39.12 
 
 		 1155 aa  772    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117254 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1775  hypothetical protein  36.59 
 
 		 1076 aa  598  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2005  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  34.64 
 
 		 1155 aa  598  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1776  hypothetical protein  36.23 
 
 		 1076 aa  590  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1741  UvrD/REP helicase  31.19 
 
 		 1162 aa  325  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.616964  hitchhiker  0.00243499 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1177 aa  148  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  23.59 
 
 		 1173 aa  144  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  23.33 
 
 		 1173 aa  143  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.29 
 
 		 1203 aa  139  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  25.73 
 
 		 1147 aa  139  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  23.03 
 
 		 1204 aa  137  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  25.27 
 
 		 1159 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  23.48 
 
 		 1121 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.79 
 
 		 1241 aa  129  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.68 
 
 		 1241 aa  129  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.92 
 
 		 1240 aa  129  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  23.48 
 
 		 1241 aa  128  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  23.48 
 
 		 1241 aa  128  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.59 
 
 		 1241 aa  128  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.76 
 
 		 1241 aa  127  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  23.24 
 
 		 1089 aa  127  1e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  25.14 
 
 		 1164 aa  127  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.98 
 
 		 1241 aa  127  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.79 
 
 		 1241 aa  126  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  25.64 
 
 		 1149 aa  127  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.84 
 
 		 1156 aa  126  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  25.24 
 
 		 1162 aa  125  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  24.92 
 
 		 1218 aa  125  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  23.75 
 
 		 1161 aa  124  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  23.22 
 
 		 1242 aa  124  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  23.98 
 
 		 1241 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  22.69 
 
 		 1156 aa  123  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  25.13 
 
 		 1184 aa  122  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  23.4 
 
 		 1119 aa  122  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.76 
 
 		 715 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  26.13 
 
 		 1124 aa  119  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  24.43 
 
 		 1106 aa  118  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  23.44 
 
 		 1080 aa  115  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  23.52 
 
 		 1187 aa  116  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  27.2 
 
 		 1121 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  24.63 
 
 		 1125 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  23.38 
 
 		 1217 aa  114  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  23.38 
 
 		 1217 aa  114  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.21 
 
 		 772 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.26 
 
 		 1230 aa  113  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4154  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.05 
 
 		 781 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.906632 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  24.97 
 
 		 854 aa  112  3e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4114  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.05 
 
 		 781 aa  113  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  23.1 
 
 		 1185 aa  111  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  23.13 
 
 		 739 aa  110  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  21.69 
 
 		 1282 aa  110  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  23.36 
 
 		 744 aa  109  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  23.63 
 
 		 1106 aa  109  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.59 
 
 		 755 aa  108  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03180  putative helicase  24.97 
 
 		 1054 aa  108  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.927265  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2985  UvrD/REP helicase  26.16 
 
 		 1131 aa  108  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.105436  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  26.1 
 
 		 1120 aa  108  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0699  UvrD/REP helicase  25.54 
 
 		 1052 aa  107  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3361  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.35 
 
 		 772 aa  107  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.876798 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4844  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.42 
 
 		 776 aa  107  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.49 
 
 		 743 aa  106  2e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  23.44 
 
 		 1189 aa  105  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2417  Exodeoxyribonuclease V  22.94 
 
 		 1124 aa  105  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.48 
 
 		 1089 aa  105  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.62 
 
 		 758 aa  105  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0776  UvrD/REP helicase  27.44 
 
 		 1143 aa  104  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  23.72 
 
 		 1164 aa  104  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  26.1 
 
 		 1196 aa  104  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  22.2 
 
 		 724 aa  103  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  23.55 
 
 		 1183 aa  103  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  23.95 
 
 		 1230 aa  102  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1061 aa  102  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1910  UvrD/REP helicase  24.91 
 
 		 907 aa  102  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4232  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.48 
 
 		 781 aa  102  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.491131  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  25.49 
 
 		 1226 aa  102  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  29.66 
 
 		 1047 aa  101  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  24.95 
 
 		 678 aa  100  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.24 
 
 		 1139 aa  100  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  25.9 
 
 		 817 aa  100  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  22.54 
 
 		 731 aa  100  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0306  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.23 
 
 		 802 aa  100  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3578  UvrD/REP helicase  22.08 
 
 		 995 aa  100  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03281  UvrD/REP helicase  26.32 
 
 		 802 aa  100  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  24.22 
 
 		 1168 aa  100  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.01 
 
 		 1177 aa  100  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  24.87 
 
 		 1087 aa  99.4  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0386  putative recombination protein RecB  41.98 
 
 		 921 aa  99.4  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.717067  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  23.09 
 
 		 1183 aa  99.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.26 
 
 		 742 aa  99.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  26.52 
 
 		 723 aa  99.4  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>