More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05405 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_05405  putative glycosyltransferase  100 
 
 
231 aa  473  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.507881  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1563  glycosyl transferase family protein  42.41 
 
 
252 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633792  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  38.86 
 
 
242 aa  169  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8285  glycosyl transferase family 2  37.62 
 
 
694 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.493669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4901  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 
229 aa  121  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.447134  decreased coverage  0.000680692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2922  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 
217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.895357  hitchhiker  0.00151129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3290  glycosyl transferase family 2  32.3 
 
 
229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3758  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 
237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102205  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0306  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 
265 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
394 aa  99  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3090  glycosyl transferase family 2  32.7 
 
 
459 aa  97.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148371  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
307 aa  97.4  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
303 aa  95.1  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2755  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
224 aa  92.8  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
378 aa  92.8  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1719  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
256 aa  92  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530897  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
355 aa  86.3  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
344 aa  86.3  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  32.68 
 
 
284 aa  85.5  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  28.78 
 
 
309 aa  85.1  9e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
448 aa  84  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0979  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457196  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
332 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
321 aa  82  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0886  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  25.47 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  29.79 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
314 aa  79  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
229 aa  79  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10550  dolichyl-phosphate sugar synthase  31.05 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0345787  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0478  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0341  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
302 aa  77  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.31 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5602  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922712  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0710  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237777  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0724  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0259046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0704  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  29.54 
 
 
749 aa  75.5  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
389 aa  75.5  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 
336 aa  75.1  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1970  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.804516 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0256  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.0678648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0083  glycosyltransferase  32.59 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.413849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1727  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.350304  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  28.33 
 
 
693 aa  73.2  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1866  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0148  succinoglycan biosynthesis protein  28.07 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
411 aa  72.4  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
420 aa  72.4  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  27.7 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5467  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
418 aa  72  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66803  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  28.37 
 
 
322 aa  71.6  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 
312 aa  71.6  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
480 aa  71.6  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0173  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4085  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.449614  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  26.2 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  35.94 
 
 
450 aa  71.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  29.65 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  27.43 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  30.54 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0462  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 
388 aa  68.9  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.215189  hitchhiker  0.000000773119 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  27.96 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 
287 aa  68.6  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1537  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 
308 aa  68.6  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>