134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1997 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  94.74 
 
 		 57 aa  110  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  71.93 
 
 		 57 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  56.14 
 
 		 61 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  57.89 
 
 		 61 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  57.89 
 
 		 61 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  54.39 
 
 		 61 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  61.82 
 
 		 76 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4109  hypothetical protein  56.14 
 
 		 61 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711121 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  54.35 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  44.64 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  44.64 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  48.98 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  48.98 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2982  hypothetical protein  48.98 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  42.11 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  41.82 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  46.3 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  51.11 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  44.44 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  43.64 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  44.44 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  43.18 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  43.18 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  48.89 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.1 
 
 		 250 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  47.62 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  44.19 
 
 		 52 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  35.09 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  44.44 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  41.82 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  41.18 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  51.22 
 
 		 221 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  47.62 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  39.29 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  41.82 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  46.51 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  38.89 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  41.46 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  44.19 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1889  protein of unknown function DUF1289  37.25 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  0.458319 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06026  hypothetical protein  44.68 
 
 		 59 aa  50.4  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  44.19 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  41.18 
 
 		 55 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  41.86 
 
 		 248 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  40 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  34.48 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2096  hypothetical protein  36.84 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00698872  normal  0.744231 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  34.62 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  40.38 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  38.33 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  38.89 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2880  hypothetical protein  33.9 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244519  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  40.91 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  40.48 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  35 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  44.19 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  40.74 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  41.46 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  37.74 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1814  hypothetical protein  38.98 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  35.85 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  37.25 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  37.74 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  37.25 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  42.22 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  30.19 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3773  protein of unknown function DUF1289  40.48 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  42.22 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  42.22 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  34 
 
 		 303 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  42.22 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  43.48 
 
 		 267 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2416  hypothetical protein  41.86 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  42.22 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  42.22 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  29.09 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  42.22 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  42.22 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  43.64 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2014  hypothetical protein  39.02 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  42.22 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  43.64 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  42.22 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3459  hypothetical protein  37.74 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  44.19 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  42.22 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  33.9 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  42.22 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1799  hypothetical protein  44.19 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  42.22 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  42.22 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2207  hypothetical protein  46.51 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000511306  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1730  hypothetical protein  37.25 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  41.86 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  30 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  43.59 
 
 		 285 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  39.53 
 
 		 202 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>