More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2511 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  92.82 
 
 
348 aa  641    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  100 
 
 
348 aa  707    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  79.69 
 
 
334 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  68.44 
 
 
328 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  69.06 
 
 
328 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1258  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  69.94 
 
 
327 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.185464  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1975  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  69.94 
 
 
327 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1015  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  69.94 
 
 
327 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0151  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  69.94 
 
 
327 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.191769  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1806  oxidoreductase, NAD-binding  69.94 
 
 
327 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.677561  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1822  oxidoreductase, NAD-binding  69.94 
 
 
327 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1473  oxidoreductase domain-containing protein  70.62 
 
 
328 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1452  oxidoreductase domain-containing protein  70.94 
 
 
328 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1741  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  69.94 
 
 
327 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.994489  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  69.06 
 
 
328 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  69.06 
 
 
328 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2514  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  70.57 
 
 
327 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0152325  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1681  oxidoreductase domain-containing protein  70.31 
 
 
328 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0855152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  37.42 
 
 
329 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  33.03 
 
 
328 aa  169  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  32.21 
 
 
329 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  34.46 
 
 
354 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  36.17 
 
 
329 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  34.46 
 
 
327 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  34.97 
 
 
329 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  30.13 
 
 
320 aa  152  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  33.84 
 
 
331 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  33.64 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  31.79 
 
 
327 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  33.43 
 
 
356 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  33.53 
 
 
336 aa  143  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  34.65 
 
 
342 aa  142  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  34.46 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 
321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  33.74 
 
 
338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  32.92 
 
 
332 aa  135  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  31.43 
 
 
362 aa  135  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  36 
 
 
338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  29.46 
 
 
327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  31.12 
 
 
352 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 
321 aa  132  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  34.15 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  31.16 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  33.85 
 
 
352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  31.44 
 
 
323 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  31.32 
 
 
356 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  30.27 
 
 
359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  36.22 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  35.45 
 
 
379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 
349 aa  126  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  35.29 
 
 
354 aa  126  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.25 
 
 
349 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.25 
 
 
349 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  32.93 
 
 
357 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  34.6 
 
 
341 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
338 aa  123  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  33.44 
 
 
322 aa  123  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2588  cytidyltransferase-related domain protein  30.81 
 
 
447 aa  122  9e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
323 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 
328 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  32.92 
 
 
334 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  29.18 
 
 
319 aa  120  3e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  34.13 
 
 
358 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  28.02 
 
 
451 aa  118  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 
667 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  31.55 
 
 
345 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  27.71 
 
 
349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  29.71 
 
 
667 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  32.74 
 
 
338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 
346 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 
667 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  32.49 
 
 
665 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  30.09 
 
 
667 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  32.22 
 
 
335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  26.73 
 
 
332 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  34.5 
 
 
670 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26160  predicted dehydrogenase  33.72 
 
 
358 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0688077  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  35.25 
 
 
360 aa  107  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  31.95 
 
 
338 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 
329 aa  105  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  27.69 
 
 
388 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1210  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  28.27 
 
 
331 aa  99.4  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0408  dehydrogenase or related protein  26.29 
 
 
335 aa  98.2  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  27.52 
 
 
342 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  29.56 
 
 
327 aa  96.3  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.18 
 
 
327 aa  95.9  9e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  25.69 
 
 
326 aa  94.4  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  30.51 
 
 
321 aa  94.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  23.97 
 
 
370 aa  94.4  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  27.95 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  26.95 
 
 
342 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0842  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  23.96 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  26.63 
 
 
361 aa  91.7  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.57 
 
 
338 aa  90.9  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  34.44 
 
 
326 aa  89.7  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3379  oxidoreductase, NAD binding  25.64 
 
 
328 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586771  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3414  putative oxidoreductase YgjR  26.17 
 
 
344 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3554  oxidoreductase, NAD binding  25.64 
 
 
328 aa  89  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.487225  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3484  putative oxidoreductase YgjR  26.27 
 
 
332 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3411  putative oxidoreductase YgjR  26.17 
 
 
344 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>