More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1255 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  92.98 
 
 
413 aa  758    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  100 
 
 
413 aa  806    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  79.18 
 
 
414 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  75.86 
 
 
412 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  74.88 
 
 
412 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  74.88 
 
 
430 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  74.88 
 
 
412 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  74.88 
 
 
412 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  74.88 
 
 
412 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  74.88 
 
 
430 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  74.88 
 
 
412 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  75.94 
 
 
405 aa  551  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  76.69 
 
 
405 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  76.19 
 
 
405 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  76.19 
 
 
405 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  74.69 
 
 
410 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  73.68 
 
 
410 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  71.92 
 
 
410 aa  511  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  56.31 
 
 
425 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  54.25 
 
 
418 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  38.69 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  36.2 
 
 
420 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  36.36 
 
 
427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  35.86 
 
 
420 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  34.81 
 
 
420 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  36.93 
 
 
407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 
431 aa  192  8e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  29.38 
 
 
415 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  33.25 
 
 
407 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  33.75 
 
 
412 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  33.08 
 
 
416 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 
392 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 
415 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  36.88 
 
 
461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  28.25 
 
 
445 aa  143  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  32.41 
 
 
493 aa  136  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
395 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  31.25 
 
 
412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  28.73 
 
 
431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  31.47 
 
 
423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  26.99 
 
 
434 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  26.75 
 
 
434 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  29.68 
 
 
428 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 
425 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  27.6 
 
 
432 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
415 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  26.95 
 
 
414 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  29.68 
 
 
417 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  27.07 
 
 
420 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
420 aa  101  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  29.79 
 
 
418 aa  100  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  30.75 
 
 
390 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  34.47 
 
 
417 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 
446 aa  97.8  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  30.25 
 
 
432 aa  96.3  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  30.45 
 
 
390 aa  93.6  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  28.53 
 
 
450 aa  93.2  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 
436 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  29.25 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 
411 aa  91.3  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  23.81 
 
 
417 aa  90.9  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 
411 aa  89  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  23.86 
 
 
418 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  27.13 
 
 
434 aa  87  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  22.51 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  22.25 
 
 
410 aa  84  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
407 aa  84  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 
395 aa  84  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 
441 aa  83.2  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  27.64 
 
 
437 aa  82.4  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  21.53 
 
 
430 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  27.96 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  27.66 
 
 
433 aa  82.8  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  21.53 
 
 
430 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 
421 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  27.27 
 
 
437 aa  80.9  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  27.52 
 
 
451 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  31.29 
 
 
434 aa  80.5  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  23.68 
 
 
428 aa  79.7  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  22.58 
 
 
406 aa  79  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  24.09 
 
 
431 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 
439 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  26.84 
 
 
389 aa  79.7  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  23.39 
 
 
428 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  29.54 
 
 
417 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  26.64 
 
 
440 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  24.1 
 
 
432 aa  76.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  27.72 
 
 
426 aa  76.3  0.0000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  23.86 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  25.41 
 
 
432 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  29.95 
 
 
449 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  25.36 
 
 
432 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1497  hypothetical protein  40.86 
 
 
124 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0469396  normal  0.708073 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  21.5 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  28.93 
 
 
432 aa  73.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  24.8 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  24.8 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  20.97 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>