30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1497 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1497  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  251  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0469396  normal  0.708073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  53.66 
 
 		 420 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 413 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  39.56 
 
 		 412 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  38.46 
 
 		 430 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  38.46 
 
 		 412 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  38.46 
 
 		 412 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  38.46 
 
 		 430 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  38.46 
 
 		 412 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  38.46 
 
 		 412 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  38.46 
 
 		 412 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 427 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 405 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 405 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  40 
 
 		 410 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 405 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 412 aa  62  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  40.86 
 
 		 413 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 405 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 425 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 410 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 410 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 418 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  33.33 
 
 		 415 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  35.16 
 
 		 420 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 420 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 407 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 407 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 405 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>