More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4272 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 
451 aa  912  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  66.67 
 
 
414 aa  562  1e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  65.94 
 
 
420 aa  561  1e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.56 
 
 
404 aa  535  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.93 
 
 
408 aa  521  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  63.44 
 
 
427 aa  519  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.3 
 
 
404 aa  520  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  63.59 
 
 
429 aa  516  1e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.19 
 
 
412 aa  515  1e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  3.85676e-08  unclonable  1.52095e-15 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  62.59 
 
 
429 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  56.03 
 
 
419 aa  513  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  58.79 
 
 
425 aa  510  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  62.09 
 
 
429 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.64 
 
 
404 aa  505  1e-142  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  61.44 
 
 
418 aa  506  1e-142  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.23 
 
 
421 aa  505  1e-142  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  60.7 
 
 
429 aa  501  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.72 
 
 
774 aa  501  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  59.85 
 
 
657 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  56.75 
 
 
405 aa  499  1e-140  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  57 
 
 
405 aa  501  1e-140  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.35 
 
 
662 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.34 
 
 
416 aa  498  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.08 
 
 
419 aa  497  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  59.6 
 
 
414 aa  493  1e-138  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  59.05 
 
 
626 aa  494  1e-138  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  62 
 
 
425 aa  492  1e-138  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.64 
 
 
415 aa  488  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.58 
 
 
678 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  59.34 
 
 
650 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.29 
 
 
417 aa  487  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  58.1 
 
 
413 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  59.34 
 
 
666 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.84 
 
 
666 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.52 
 
 
664 aa  487  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  7.69952e-06 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  58.84 
 
 
688 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.12 
 
 
673 aa  486  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  56.02 
 
 
682 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.21 
 
 
621 aa  484  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  53.22 
 
 
412 aa  484  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  59.29 
 
 
661 aa  484  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  56.64 
 
 
405 aa  482  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.5 
 
 
444 aa  478  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  57.83 
 
 
604 aa  480  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.21 
 
 
406 aa  481  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.76 
 
 
608 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.72 
 
 
672 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  58.1 
 
 
404 aa  481  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  57.83 
 
 
604 aa  481  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.72 
 
 
674 aa  479  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.96 
 
 
413 aa  476  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  57.28 
 
 
414 aa  475  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.83 
 
 
605 aa  478  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  57.61 
 
 
414 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  52.72 
 
 
665 aa  474  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  57.28 
 
 
414 aa  474  1e-132  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  57.36 
 
 
415 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.61 
 
 
629 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.97 
 
 
420 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.75 
 
 
416 aa  466  1e-130  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  55.17 
 
 
412 aa  466  1e-130  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.12 
 
 
418 aa  465  1e-130  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.25 
 
 
414 aa  466  1e-130  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.36 
 
 
415 aa  467  1e-130  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.36 
 
 
428 aa  467  1e-130  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.16 
 
 
644 aa  466  1e-130  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  56.22 
 
 
417 aa  466  1e-130  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.66 
 
 
414 aa  467  1e-130  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.8 
 
 
414 aa  467  1e-130  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0362  selenocysteine lyase  57.73 
 
 
685 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.556152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0448  putative cysteine desulfurase  57.97 
 
 
660 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0933  putative cysteine desulfurase  57.97 
 
 
671 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1407  putative cysteine desulfurase  57.97 
 
 
660 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0199  putative cysteine desulfurase  57.97 
 
 
660 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75031  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.84 
 
 
414 aa  461  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1904  cysteine desulphurases, SufS  57.97 
 
 
660 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.256271  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1818  SufS family cysteine desulfurase  57.73 
 
 
660 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.12 
 
 
418 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.81 
 
 
560 aa  462  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.98 
 
 
630 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.37 
 
 
679 aa  461  1e-128  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.45 
 
 
641 aa  461  1e-128  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.53 
 
 
415 aa  458  1e-128  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.48 
 
 
414 aa  460  1e-128  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.22 
 
 
414 aa  461  1e-128  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.61 
 
 
415 aa  459  1e-128  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.59 
 
 
406 aa  458  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.21 
 
 
406 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  55.33 
 
 
406 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  55.33 
 
 
406 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.1207e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  55.22 
 
 
414 aa  454  1e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.7 
 
 
413 aa  452  1e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  55.09 
 
 
406 aa  454  1e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.58 
 
 
409 aa  452  1e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  55.61 
 
 
422 aa  453  1e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1347  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.75 
 
 
405 aa  453  1e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  hitchhiker  1.39909e-10 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  51.61 
 
 
406 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.39 
 
 
417 aa  450  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  51.61 
 
 
406 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  55.33 
 
 
406 aa  449  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  2.89207e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>