269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2712 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2712  AIR synthase related protein domain protein  100 
 
 		 327 aa  653    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  88.38 
 
 		 327 aa  584  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4564  AIR synthase-like protein  74.69 
 
 		 328 aa  488  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299231  normal  0.430179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0558  AIR synthase related protein  65.52 
 
 		 332 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2101  AIR synthase related protein  64.15 
 
 		 341 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3475  hypothetical protein  63.29 
 
 		 342 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5396  AIR synthase related protein  56.78 
 
 		 331 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0059  AIR synthase related protein  55.9 
 
 		 331 aa  334  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.148611  normal  0.181031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0248  AIR synthase related protein  59.49 
 
 		 331 aa  331  8e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  0.676888 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  54.6 
 
 		 328 aa  331  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2622  AIR synthase related protein domain protein  52.17 
 
 		 328 aa  314  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1995  AIR synthase related protein  52.35 
 
 		 323 aa  306  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4748  AIR synthase related protein  54.35 
 
 		 334 aa  296  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0560199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  42.27 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13161  hypothetical protein  38.85 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0836  hypothetical protein  43.35 
 
 		 338 aa  212  5.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.261675 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1750  methanogenesis marker protein 2  36.14 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1267  AIR synthase related protein  34.27 
 
 		 331 aa  192  6e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0131  thiamin-monophosphate kinase  34.78 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1073  AIR synthase related protein  36.34 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0917  AIR synthase related protein  32.51 
 
 		 333 aa  179  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0496  hypothetical protein  35.91 
 
 		 331 aa  179  8e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0832  AIR synthase-like protein  36.22 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.786385  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0496  AIR synthase related protein  30.67 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0762  AIR synthase-like protein  36.39 
 
 		 321 aa  169  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.353751  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0844  AIR synthase related protein  31.29 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223576  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1139  methanogenesis marker protein 2  29.14 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0044  AIR synthase related protein  29.45 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0779  AIR synthase related protein  29.45 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.278492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  35.27 
 
 		 479 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  34.03 
 
 		 481 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  34.84 
 
 		 486 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 		 471 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  31.93 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  30.04 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  26.76 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  27.67 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  35.95 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  27.78 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  26.62 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0583  thiamine-monophosphate kinase  32.41 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1455  thiamine-monophosphate kinase  27.95 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  33.47 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  35.25 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  31.45 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  30.8 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  27.09 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  34.06 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  29.2 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  30.51 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  29.48 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  26.06 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  24.58 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  30.99 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  29.65 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  30.29 
 
 		 346 aa  57  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  27.71 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2006  thiamine-monophosphate kinase  32.45 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0447  thiamine-monophosphate kinase  35.29 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  31.69 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  30.87 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1127  AIR synthase related protein  30.46 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  26.02 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  28.92 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1539  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.66 
 
 		 717 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  32.13 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  32.33 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6116  selenide, water dikinase  35.88 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  24.75 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1681  AIR synthase related protein domain protein  27.27 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  30.63 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  29.41 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  30.58 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  30.63 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21270  AIR synthase related protein domain protein  24.27 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.0242e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  34.56 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  27.05 
 
 		 528 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1966  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.71 
 
 		 731 aa  53.9  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0460  thiamine-monophosphate kinase  31.3 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  27.62 
 
 		 346 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  30.37 
 
 		 355 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  33.48 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  25.62 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  28.47 
 
 		 329 aa  53.9  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  30 
 
 		 344 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  28.17 
 
 		 333 aa  53.5  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3919  thiamine-monophosphate kinase  31.38 
 
 		 331 aa  53.5  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  30.37 
 
 		 351 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  30.26 
 
 		 346 aa  52.8  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  29.73 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  33.08 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0846  cell division GTPase-like protein  27.07 
 
 		 438 aa  51.2  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  29.32 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  28.45 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3537  thiamine-monophosphate kinase  28.37 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.719113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1802  AIR synthase related protein  28.15 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0640  AIR synthase related protein domain protein  24.12 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221872  normal  0.692624 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  29.49 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1543  thiamine-monophosphate kinase  30 
 
 		 314 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  32.42 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>