199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4176 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4176  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  100 
 
 
288 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7092  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  58.51 
 
 
289 aa  330  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5942  hypothetical protein  38.59 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.98 
 
 
310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68670  putative carboxypeptidase  38.26 
 
 
307 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  36.55 
 
 
311 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.69 
 
 
305 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1956  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.44 
 
 
319 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  31.79 
 
 
306 aa  153  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2200  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.42 
 
 
339 aa  152  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.498556  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  31.34 
 
 
306 aa  152  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  31.34 
 
 
306 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.91 
 
 
305 aa  151  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  30.63 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5967  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.58 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  30.99 
 
 
361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  30.25 
 
 
306 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  30.25 
 
 
306 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  30.25 
 
 
306 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  30.25 
 
 
306 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  30.25 
 
 
306 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3393  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.19 
 
 
344 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  29.93 
 
 
306 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0362  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.91 
 
 
298 aa  142  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.21 
 
 
348 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  29.86 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1664  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.33 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191805  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.38 
 
 
348 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  29.51 
 
 
293 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  33.78 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.87 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2030  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  35.86 
 
 
333 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.630907  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  29.14 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3478  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.17 
 
 
321 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1218  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31.12 
 
 
299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.190854  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4290  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  33.8 
 
 
299 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.29 
 
 
309 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04130  putative carboxypeptidase  30.74 
 
 
300 aa  132  6.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4434  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.51 
 
 
297 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1963  hypothetical protein  34.48 
 
 
298 aa  132  7.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4498  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.22 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5153  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.28 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  36.99 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2396  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.65 
 
 
296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309773  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3542  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.17 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3395  peptidase S66, LD-carboxypeptidase A  34.48 
 
 
321 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6755  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.82 
 
 
315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.22 
 
 
305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4459  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  28.37 
 
 
301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7443  putative muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  35.74 
 
 
310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19840  uncharacterized MccF-like protein (microcin C7 resistance)  36.43 
 
 
306 aa  129  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.261069  decreased coverage  0.0000458463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5012  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31.03 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.915313  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5403  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.37 
 
 
285 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.381396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0082  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.22 
 
 
299 aa  125  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.176259  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3337  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  36.46 
 
 
309 aa  125  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3416  carboxypeptidase  28.83 
 
 
292 aa  123  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6860  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.84 
 
 
348 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4524  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.6 
 
 
309 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.07 
 
 
312 aa  122  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2668  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.17 
 
 
296 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2333  L,D-carboxypeptidase A  32.89 
 
 
308 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4962  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  32.4 
 
 
315 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3212  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.13 
 
 
325 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0799  hypothetical protein  34.11 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.08 
 
 
341 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.51 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7067  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.01 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2712  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.72 
 
 
310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0622  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.12 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1921  L,D-carboxypeptidase A  32.57 
 
 
308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.271346 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.6 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1415  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  31.56 
 
 
314 aa  113  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0048  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.71 
 
 
321 aa  112  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1854  hypothetical protein  32.17 
 
 
317 aa  112  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  29.72 
 
 
297 aa  112  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6400  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.71 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.80456 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1513  L,D-carboxypeptidase A  32.19 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2537  L,D-carboxypeptidase A  32.19 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2063  L,D-carboxypeptidase A  32.3 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0548  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  29.43 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05111  putative carboxypeptidase  26.15 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0583288  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3298  L,D-carboxypeptidase A  32.19 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.968546  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2393  L,D-carboxypeptidase A  32.19 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2436  L,D-carboxypeptidase A  32.19 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0765003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1284  L,D-carboxypeptidase A  32.19 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.017438  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1015  hypothetical protein  26.17 
 
 
325 aa  110  3e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.654052  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  28.33 
 
 
318 aa  109  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4674  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.88 
 
 
312 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4799  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  30.88 
 
 
312 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.26616 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  31.78 
 
 
316 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1749  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  34.52 
 
 
319 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0546676  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5103  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.1 
 
 
301 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04801  putative carboxypeptidase  27.37 
 
 
289 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.957577  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2012  L,D-carboxypeptidase A  31.85 
 
 
313 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0543  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.23 
 
 
314 aa  106  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.646372  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1304  L,D-carboxypeptidase A  34.05 
 
 
308 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.504378  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05101  putative carboxypeptidase  29.89 
 
 
291 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.252478 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06571  putative carboxypeptidase  30.39 
 
 
299 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1333  L,D-carboxypeptidase A  30.56 
 
 
304 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186557  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2034  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  31.87 
 
 
308 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.146137 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>