232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3528 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  100 
 
 		 246 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  74.39 
 
 		 246 aa  390  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  70.9 
 
 		 245 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  47.74 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  46.72 
 
 		 241 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5811  OmpW family protein  41.53 
 
 		 248 aa  205  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0168261 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  44.19 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  43.72 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  38.4 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  41.33 
 
 		 243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  39.83 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  39.83 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  40.18 
 
 		 243 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  37.89 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  40.62 
 
 		 243 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  39.73 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  39.73 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  36.29 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  38.46 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  38.46 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  38.46 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  38.46 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  38.46 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  38.46 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  38.46 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  38.84 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  38.84 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  38.84 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  36.6 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  38.53 
 
 		 243 aa  158  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  35.25 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  35.25 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  35.25 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000541983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  35.25 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  35.25 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  35.25 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  35.25 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000517916  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  35.25 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  34.17 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00001264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0238  OmpW family protein  35.02 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000689668  unclonable  0.0000000000300165 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0214  OmpW family protein  34.63 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000152591  unclonable  0.00000000000991303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0291  OmpW family protein  34.63 
 
 		 277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251819  unclonable  0.0000000000417391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  32.46 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0230  OmpW family protein  35.02 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000579119  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3410  OmpW family protein  34.63 
 
 		 277 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000136478  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  33.45 
 
 		 286 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  35.39 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  32.84 
 
 		 274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2795  OmpW  33.85 
 
 		 277 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0311  OmpW family protein  33.85 
 
 		 277 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300179  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  32 
 
 		 274 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  30.55 
 
 		 274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5178  OmpW family protein  29.82 
 
 		 274 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3265  OmpW  29.82 
 
 		 274 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5103  OmpW family protein  29.82 
 
 		 274 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  30.18 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  30.18 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3131  OmpW family outer membrane protein  31.52 
 
 		 290 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2734  OmpW family outer membrane protein  31.52 
 
 		 290 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.355181  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1875  OmpW family outer membrane protein  31.52 
 
 		 290 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.253498  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0901  OmpW family outer membrane protein  31.52 
 
 		 290 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2010  OmpW family outer membrane protein  31.64 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3168  OmpW family outer membrane protein  31.16 
 
 		 290 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3185  OmpW family outer membrane protein  31.52 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0684356  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  32.69 
 
 		 282 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  32.26 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  31.85 
 
 		 308 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2023  OmpW family protein  31.64 
 
 		 274 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  0.457638 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2417  OmpW family protein  31.64 
 
 		 274 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.729819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  30.17 
 
 		 215 aa  99.4  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  32.1 
 
 		 214 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  31.82 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  28.93 
 
 		 215 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  28.93 
 
 		 215 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  28.38 
 
 		 232 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  29.6 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  29.22 
 
 		 215 aa  92  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  29.05 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  29.29 
 
 		 212 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  29.29 
 
 		 212 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  29.29 
 
 		 212 aa  90.1  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  30.04 
 
 		 214 aa  89.7  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  30.17 
 
 		 210 aa  89  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  27.57 
 
 		 215 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  30.36 
 
 		 218 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  27.57 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  28.87 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  28.87 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  28.87 
 
 		 212 aa  87  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  28.87 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  28.87 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  28.87 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  30 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  28.81 
 
 		 214 aa  86.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  27.69 
 
 		 215 aa  85.9  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  29.02 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  27.46 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  27.46 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  30.08 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  27.19 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>