46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6264 on replicon NC_010070
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010070  Bmul_6264  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 188 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0000184029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2441  DNA-binding protein  60.87 
 
 		 80 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1246  DNA-binding protein  60.87 
 
 		 80 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1559  DNA-binding protein  60.87 
 
 		 80 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810667  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0719  DNA-binding protein  59.42 
 
 		 80 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1707  DNA-binding protein  59.42 
 
 		 80 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0743  DNA-binding protein  59.42 
 
 		 80 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4563  transcriptional regulator, XRE family  55.88 
 
 		 80 aa  82  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3948  XRE family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 73 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697178 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 95 aa  57  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1469  Cro/CI family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0717  DNA-binding protein  40.85 
 
 		 80 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0622  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.74 
 
 		 80 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831827  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3550  XRE family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 92 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0545283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0800  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 97 aa  51.2  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2731  DNA-binding protein  36.49 
 
 		 85 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989155  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5908  helix-turn-helix domain protein  40.26 
 
 		 88 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84632  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  44.12 
 
 		 80 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  42.86 
 
 		 90 aa  48.5  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1813  helix-turn-helix domain-containing protein  37.31 
 
 		 80 aa  47.8  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.464134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 100 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03892  DNA-binding protein  51.06 
 
 		 82 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4916  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 81 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.366268  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  32.05 
 
 		 94 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5654  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 78 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279432  normal  0.298954 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4878  transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0810  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 85 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0041  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 76 aa  45.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0512908  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 81 aa  45.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  42 
 
 		 93 aa  45.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2018  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 83 aa  45.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.97795  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2106  hypothetical protein  43.75 
 
 		 84 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 83 aa  43.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0638  XRE family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 74 aa  42.7  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000543981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0576  XRE family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 74 aa  42.7  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016932  normal  0.922143 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  38.89 
 
 		 94 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1652  XRE family transcriptional regulator  70 
 
 		 76 aa  42.4  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000422118  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 81 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  58.82 
 
 		 110 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  38.89 
 
 		 94 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 67 aa  42  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3691  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 85 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0902  transcriptional regulator, XRE family  40.82 
 
 		 82 aa  41.6  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3635  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 85 aa  41.2  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.314503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6666  helix-turn-helix domain protein  42.31 
 
 		 102 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384306  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4570  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 99 aa  40.8  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.27714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>