More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04360 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  100 
 
 
285 aa  550  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  53.6 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  48.23 
 
 
261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  47.06 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  50 
 
 
262 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  52.23 
 
 
261 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  52.23 
 
 
261 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  45.06 
 
 
384 aa  211  9e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  52.23 
 
 
261 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  48.21 
 
 
280 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  50.89 
 
 
265 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  47.98 
 
 
264 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  43.22 
 
 
285 aa  199  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3914  ABC transporter related  54.04 
 
 
274 aa  199  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00146418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  47.2 
 
 
262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  52.61 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  45.66 
 
 
259 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.44 
 
 
253 aa  198  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  35.68 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  41.92 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  38.63 
 
 
321 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  38.63 
 
 
321 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  35.27 
 
 
266 aa  195  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  44.93 
 
 
307 aa  195  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48.66 
 
 
265 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  48.66 
 
 
263 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48.66 
 
 
295 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  42.02 
 
 
264 aa  194  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  48.66 
 
 
265 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48.66 
 
 
263 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  38.49 
 
 
268 aa  194  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  48.66 
 
 
265 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  48.66 
 
 
265 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.75 
 
 
259 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  45.73 
 
 
267 aa  192  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  37.87 
 
 
269 aa  192  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  40.17 
 
 
259 aa  192  4e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  42.19 
 
 
324 aa  192  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  39.83 
 
 
409 aa  192  8e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  38.98 
 
 
279 aa  191  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  42.23 
 
 
261 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  40.85 
 
 
326 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  38.98 
 
 
308 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  35.51 
 
 
251 aa  188  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  43.64 
 
 
269 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.15 
 
 
285 aa  186  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  48.94 
 
 
257 aa  186  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  40 
 
 
293 aa  186  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  45.96 
 
 
257 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  44.49 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  41.08 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0175  ABC transporter related  47.91 
 
 
265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.406757  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  44.17 
 
 
424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 
264 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  43.02 
 
 
275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  49.56 
 
 
273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  47.44 
 
 
263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  39.41 
 
 
266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  42.13 
 
 
253 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  40.76 
 
 
490 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  42.74 
 
 
274 aa  182  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  42.74 
 
 
274 aa  182  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3725  ABC transporter related protein  46.58 
 
 
249 aa  181  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0187  ABC transporter related protein  47.91 
 
 
265 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  38.24 
 
 
297 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  38.24 
 
 
297 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  36.84 
 
 
258 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  38.24 
 
 
297 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  38.24 
 
 
297 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  47.66 
 
 
339 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  43.35 
 
 
264 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  40.34 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  34.58 
 
 
418 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.02 
 
 
265 aa  179  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  41 
 
 
268 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40 
 
 
271 aa  179  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1166  putative vitamin B12 transport ATP-binding protein BtuD  38.02 
 
 
276 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.468222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  37.07 
 
 
259 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3325  ABC transporter-related protein  46.08 
 
 
257 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.946255  normal  0.977601 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  43.91 
 
 
262 aa  178  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  40.34 
 
 
259 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  41.45 
 
 
275 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  42.69 
 
 
262 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  45 
 
 
283 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2322  ABC transporter related protein  43.4 
 
 
261 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  43.16 
 
 
270 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  41.45 
 
 
275 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  45.75 
 
 
255 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2242  ABC transporter ATP-binding protein  47.96 
 
 
257 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26400  putative ATP-binding component of ABC transporter  47.51 
 
 
257 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.749781  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3775  ABC transporter related protein  43.28 
 
 
265 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  40.25 
 
 
269 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  41.98 
 
 
266 aa  175  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.71 
 
 
262 aa  175  7e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2056  ABC transporter related  45.53 
 
 
262 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  43.87 
 
 
262 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  43.17 
 
 
254 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  42.8 
 
 
254 aa  175  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0560  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  46.22 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1610  ABC transporter related protein  46.46 
 
 
315 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0728276  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>