More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00990 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00990  cytosine/adenosine deaminase  100 
 
 		 175 aa  353  5e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0864  Cytosine deaminase  73.15 
 
 		 165 aa  224  6e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1480  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.79 
 
 		 145 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2506  cytosine deaminase  63.12 
 
 		 149 aa  192  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0043356  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.68 
 
 		 145 aa  191  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1980  cytosine deaminase  62.68 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.597926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2556  cytosine deaminase  63.01 
 
 		 149 aa  189  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1483  Cytosine deaminase  60.84 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4144  cytosine deaminase  61.64 
 
 		 154 aa  184  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4158  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.75 
 
 		 160 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1635  cytosine deaminase  55.63 
 
 		 145 aa  182  3e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.503034  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1435  Cytosine deaminase  57.79 
 
 		 153 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.317365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3776  cytosine deaminase  57.45 
 
 		 145 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.650074  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3869  cytosine deaminase  57.04 
 
 		 145 aa  179  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0725206  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78481  cytosine deaminase  56.85 
 
 		 150 aa  178  4e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.701177  normal  0.798696 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1397  cytosine deaminase  55.32 
 
 		 145 aa  176  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1602  cytosine deaminase  56.03 
 
 		 145 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0907  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  57.34 
 
 		 146 aa  175  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.459324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1204  cytosine deaminase  55.32 
 
 		 145 aa  174  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0117  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.61 
 
 		 145 aa  174  6e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.515188 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0051  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.69 
 
 		 146 aa  173  9e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1307  cytosine deaminase  58.45 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3086  cytosine deaminase  53.19 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1290  Cytosine deaminase  53.19 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.589706 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2798  cytosine deaminase  54.61 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1786  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.19 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315123  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2881  cytosine deaminase  54.61 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3077  cytosine deaminase  53.19 
 
 		 145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3229  cytosine deaminase  53.19 
 
 		 145 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2977  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.9 
 
 		 145 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0945  cytosine deaminase  55.63 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353729  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0677  cytosine deaminase  51.77 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5742  Cytosine deaminase  48.94 
 
 		 144 aa  161  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1318  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  159  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.15 
 
 		 160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.05 
 
 		 274 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3461  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.65 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2066  Cytosine deaminase  50.67 
 
 		 165 aa  139  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2579  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.95 
 
 		 146 aa  137  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05950  cytosine deaminase, putative  46.31 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275444  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0892  cytosine deaminase  46.43 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1204  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.84 
 
 		 143 aa  134  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04267  cytosine deaminase  45.64 
 
 		 151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205672  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1816  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.55 
 
 		 144 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468453  normal  0.80703 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1123  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.84 
 
 		 147 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1414  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.86 
 
 		 143 aa  131  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276842  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.07 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4937  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  41.84 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0889323 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3674  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.07 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3606  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.07 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241267  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3601  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  45.07 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00422327  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0498  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.57 
 
 		 139 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0144132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0485  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.57 
 
 		 139 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5409  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.27 
 
 		 158 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.210093  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0824  cytosine deaminase  42.14 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.385917  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0501  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.62 
 
 		 149 aa  90.9  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.71 
 
 		 154 aa  85.1  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4222  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.94 
 
 		 157 aa  84.3  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.43 
 
 		 156 aa  84  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.43 
 
 		 156 aa  84  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.92 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.43 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1229  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.14 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0616301  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  39.45 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.5 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  34.75 
 
 		 151 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1413  tRNA-adenosine deaminase  43.16 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.24 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  39.81 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1819  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein, putative  35.78 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000174201  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.56 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  32.65 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  43 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.2 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3893  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.62 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5296  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  41.41 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000172102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.57 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  40.59 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0274  tRNA-adenosine deaminase  36.04 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  41.41 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  31.87 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0020  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  40.59 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.59 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.59 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.736614  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  40.59 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  40.59 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125537  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1525  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.65 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  31.87 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  31.1 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  31.87 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.4 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.59 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  31.87 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  31.87 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  31.1 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  31.1 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.12 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>