More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1021 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
300 aa  632  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  98.33 
 
 
300 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  98 
 
 
300 aa  624  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  98 
 
 
300 aa  624  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  98.33 
 
 
300 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  97 
 
 
300 aa  618  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  97.67 
 
 
300 aa  620  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  96.67 
 
 
300 aa  616  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  95.67 
 
 
300 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  95.33 
 
 
300 aa  607  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  34.1 
 
 
298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 
279 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  29 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  31.33 
 
 
279 aa  145  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  30.64 
 
 
285 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 
280 aa  142  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 
313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  30.82 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  29.43 
 
 
281 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  29.9 
 
 
291 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 
290 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  30.82 
 
 
291 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  30.49 
 
 
290 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 
290 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 
290 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 
281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 
280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 
290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  30.13 
 
 
290 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 
290 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 
284 aa  135  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  29.14 
 
 
290 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  29.22 
 
 
290 aa  132  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 
290 aa  132  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  30.17 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  29.84 
 
 
287 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  30.51 
 
 
279 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  27.51 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  27.36 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 
281 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  28.16 
 
 
281 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  28.38 
 
 
281 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 
292 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  32.24 
 
 
287 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 
279 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 
301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 
271 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3181  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 
292 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  29.8 
 
 
294 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  25.82 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  26.35 
 
 
287 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  27.91 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  26.89 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  26.07 
 
 
289 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2780  transcriptional regulator, AraC family  26.64 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0531003  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  27.3 
 
 
302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  26.44 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  26.89 
 
 
289 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1472  AraC family transcriptional regulator  24.58 
 
 
294 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.102681  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1127  transcriptional regulator, AraC family  26.89 
 
 
288 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  27.45 
 
 
310 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  49.52 
 
 
299 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  48.57 
 
 
299 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  47.62 
 
 
299 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  47.62 
 
 
299 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  47.62 
 
 
299 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  26.98 
 
 
308 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  47.62 
 
 
299 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0329  transcription activator effector binding protein  27.96 
 
 
288 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0236652  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  47.62 
 
 
299 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2127  transcription activator effector binding protein  28.39 
 
 
290 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 
288 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  45.37 
 
 
436 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
288 aa  99.4  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  27.19 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 
286 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 
326 aa  96.3  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  28.72 
 
 
288 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0186  transcriptional regulator, AraC family  44.34 
 
 
452 aa  92.8  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 
129 aa  92.8  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 
294 aa  92.4  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04745  transcriptional regulator  37.96 
 
 
255 aa  92.4  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  26.6 
 
 
306 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  25.32 
 
 
296 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1683  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 
221 aa  90.1  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0910  HTH-type transcription regulator, AraC-family  27.16 
 
 
298 aa  89.7  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  24.84 
 
 
296 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  25.32 
 
 
297 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3013  transcription activator, effector binding  28.94 
 
 
289 aa  89  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  24.42 
 
 
277 aa  89.4  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0137  AraC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
315 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.10009 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0076  transcription activator, effector binding  28.01 
 
 
288 aa  89  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0568  transcriptional regulator, AraC family  27.04 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.117041  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1798  transcriptional regulator, AraC family  28.31 
 
 
200 aa  88.6  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  24.62 
 
 
296 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  25.85 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1266  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 
300 aa  87  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.23796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>