223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1468 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
315 aa  649    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  92.06 
 
 
315 aa  607  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  92.04 
 
 
315 aa  603  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  92.04 
 
 
315 aa  603  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  92.04 
 
 
315 aa  603  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  92.06 
 
 
316 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  92.04 
 
 
315 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  91.43 
 
 
315 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  92.04 
 
 
315 aa  603  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  91.72 
 
 
315 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  91.72 
 
 
315 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  47.27 
 
 
310 aa  293  3e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  38.08 
 
 
307 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  32.26 
 
 
315 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0561  transcriptional regulator, DeoR family  32.81 
 
 
322 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  34.82 
 
 
317 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3288  transcriptional regulator, DeoR family  34.07 
 
 
324 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112061  normal  0.0190392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2251  DeoR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
320 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0678126  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1988  transcriptional regulator, DeoR family  31.46 
 
 
324 aa  172  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000190118 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2524  DeoR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
357 aa  172  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
317 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06830  transcriptional regulator  32.27 
 
 
320 aa  169  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29950  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  31.58 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  33.55 
 
 
316 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  32.01 
 
 
321 aa  159  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  32.49 
 
 
327 aa  159  7e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
334 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  29.39 
 
 
323 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  32.38 
 
 
316 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1869  transcriptional regulator, DeoR family  30.31 
 
 
335 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273722  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  32.13 
 
 
328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4358  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 
339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4444  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 
339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0599387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4738  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 
339 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  32.57 
 
 
316 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  31.95 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  32.25 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  28.9 
 
 
308 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  29.08 
 
 
313 aa  146  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  31.72 
 
 
315 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  31.72 
 
 
315 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  31.39 
 
 
315 aa  142  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0488  transcriptional regulator, DeoR family  30.67 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  28.21 
 
 
310 aa  135  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  27.88 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2395  transcriptional regulator, putative  31.75 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  27.88 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  31.23 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  27.56 
 
 
313 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  27.56 
 
 
362 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  27.56 
 
 
315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  27.24 
 
 
316 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  28.85 
 
 
314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  28.85 
 
 
314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  27.24 
 
 
310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  31.8 
 
 
694 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  27.71 
 
 
310 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3378  DeoR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
314 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  28.38 
 
 
321 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2643  transcriptional regulator, DeoR family  28.84 
 
 
314 aa  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000047791  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3725  transcriptional regulator, DeoR family  30.48 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000852212  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  30.82 
 
 
700 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03820  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  28.34 
 
 
318 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  32.79 
 
 
694 aa  126  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0522  transcriptional regulator  27.39 
 
 
319 aa  125  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
320 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3426  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 
336 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000128102  hitchhiker  0.000369774 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2088  transcriptional regulator, DeoR family  31.41 
 
 
315 aa  123  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  25.82 
 
 
338 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  27.42 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  28.03 
 
 
320 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  27.42 
 
 
325 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  26.69 
 
 
321 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  27.39 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02313  putative transcriptional regulator  28.1 
 
 
318 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00764074  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  25.16 
 
 
339 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2553  DeoR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
342 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2598  DeoR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
342 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0969479  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2592  DeoR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
342 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0641807  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  26.77 
 
 
325 aa  116  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3753  transcriptional regulator, DeoR family  29.67 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188827  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2359  DeoR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711472  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3451  transcriptional regulator, DeoR family  28.52 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5885  DeoR family transcriptional regulator  25.24 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
342 aa  113  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  26.47 
 
 
334 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0532  transcriptional regulator  25.56 
 
 
324 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3563  hypothetical protein  30.23 
 
 
317 aa  113  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  27.8 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2858  DeoR family transcriptional regulator  24.84 
 
 
310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  27.48 
 
 
317 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  27.48 
 
 
317 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  27.48 
 
 
317 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>