More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6889 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6889  major facilitator transporter  100 
 
 
400 aa  756    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398856  normal  0.655887 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  45.99 
 
 
400 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  45.34 
 
 
399 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  40.1 
 
 
404 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  43.08 
 
 
399 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  43.32 
 
 
429 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  43.11 
 
 
429 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  43.78 
 
 
398 aa  255  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  44.04 
 
 
398 aa  255  8e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  43.78 
 
 
398 aa  255  8e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  43.78 
 
 
398 aa  255  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  43.78 
 
 
398 aa  255  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  44.76 
 
 
399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  45.52 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  44.32 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  45.01 
 
 
399 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  45.27 
 
 
399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  45.27 
 
 
399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  44.09 
 
 
398 aa  243  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  43.32 
 
 
399 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  34.62 
 
 
394 aa  236  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  43.55 
 
 
415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  44.74 
 
 
403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  43.35 
 
 
394 aa  233  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  36.27 
 
 
403 aa  232  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  43.24 
 
 
391 aa  230  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  43.3 
 
 
394 aa  229  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  42.56 
 
 
415 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  34.57 
 
 
415 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  42.82 
 
 
389 aa  226  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  43.02 
 
 
394 aa  225  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  41.4 
 
 
407 aa  220  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  43.29 
 
 
389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4800  major facilitator transporter  41.62 
 
 
412 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5392  major facilitator transporter  41.62 
 
 
412 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0287626  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5469  major facilitator transporter  41.62 
 
 
412 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414502  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  40.32 
 
 
403 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4363  major facilitator transporter  42.32 
 
 
403 aa  212  9e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  40.31 
 
 
395 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  41.94 
 
 
405 aa  211  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  36.25 
 
 
399 aa  210  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  36.25 
 
 
399 aa  210  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  36.25 
 
 
399 aa  210  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  41.34 
 
 
410 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  39.28 
 
 
403 aa  209  9e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4774  major facilitator superfamily MFS_1  41.78 
 
 
389 aa  208  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3219  major facilitator superfamily MFS_1  41.46 
 
 
396 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  37.43 
 
 
399 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  36.34 
 
 
383 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  36.15 
 
 
399 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  36.15 
 
 
399 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  40.32 
 
 
403 aa  206  8e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  38.94 
 
 
396 aa  205  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  43.1 
 
 
407 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  35.98 
 
 
393 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  36.44 
 
 
399 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  40.16 
 
 
389 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5352  major facilitator transporter  42.18 
 
 
410 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660653  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4811  major facilitator transporter  42.18 
 
 
410 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
406 aa  202  8e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  37.39 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3845  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 
406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0254807  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3959  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 
406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.177015  normal  0.0110236 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  36.24 
 
 
385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  36.92 
 
 
399 aa  199  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 
406 aa  199  7.999999999999999e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  37.83 
 
 
395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2949  major facilitator transporter  42.15 
 
 
405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137006  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  36.44 
 
 
398 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3939  major facilitator superfamily MFS_1  44.57 
 
 
408 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0153  major facilitator superfamily MFS_1  38.17 
 
 
419 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 
413 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  40.67 
 
 
402 aa  192  9e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05543  hypothetical protein  38.19 
 
 
399 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331898  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  36.7 
 
 
398 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3317  major facilitator transporter  41.34 
 
 
411 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.209632 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1580  major facilitator superfamily MFS_1  43.57 
 
 
425 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.551753  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  39.89 
 
 
413 aa  188  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  33.9 
 
 
389 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  33.9 
 
 
389 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  40.77 
 
 
402 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00295222  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1909  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 
408 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.765785  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  34.56 
 
 
394 aa  186  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  36.87 
 
 
400 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1738  major facilitator superfamily MFS_1  40.55 
 
 
402 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.567776  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  35.98 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  34.56 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  34.56 
 
 
394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  36.87 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  34.56 
 
 
394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  36.87 
 
 
400 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  34.56 
 
 
394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  35.39 
 
 
405 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  35.85 
 
 
394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  35.45 
 
 
405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 
447 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  35.87 
 
 
405 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  35.1 
 
 
405 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  35.6 
 
 
405 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>