More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1766 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3272  transcriptional regulator  87.9 
 
 		 493 aa  870    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.831292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1766  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 495 aa  999    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0178968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4121  GntR family transcriptional regulator  87.3 
 
 		 493 aa  862    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648363  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3667  GntR family transcriptional regulator  84.1 
 
 		 494 aa  840    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4245  GntR family transcriptional regulator  87.3 
 
 		 493 aa  862    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0459012 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1059  GntR family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 500 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611003  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0766  GntR family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 500 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.106463  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1775  GntR family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 500 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2034  GntR family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 500 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0773  GntR family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 500 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199423  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0682  GntR family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 500 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.984752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2058  GntR family regulatory protein  63.89 
 
 		 500 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.51988  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1916  GntR family transcriptional regulator  62.8 
 
 		 500 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 496 aa  283  6.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 477 aa  276  8e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  36.01 
 
 		 503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 569 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  35.49 
 
 		 523 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 470 aa  274  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 502 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  35.64 
 
 		 502 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 502 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 502 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 502 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  34.79 
 
 		 490 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.37 
 
 		 501 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1108  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 492 aa  270  4e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 503 aa  269  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  35.31 
 
 		 520 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 494 aa  267  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 501 aa  267  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.43 
 
 		 471 aa  266  7e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 494 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 494 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 509 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  35.11 
 
 		 509 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 		 492 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 520 aa  264  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 509 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.71 
 
 		 515 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  36.66 
 
 		 494 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  38.31 
 
 		 495 aa  263  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  36.74 
 
 		 509 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 507 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  36.03 
 
 		 507 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 494 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 546 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 564 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 507 aa  262  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 564 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3945  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 476 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  35.24 
 
 		 561 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 562 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.51 
 
 		 472 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6170  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.64 
 
 		 523 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 490 aa  260  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 501 aa  259  7e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 495 aa  259  8e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.58 
 
 		 473 aa  259  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  35.86 
 
 		 444 aa  259  9e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0497  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 463 aa  259  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 508 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  35.24 
 
 		 564 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 564 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 513 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 502 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 473 aa  256  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 511 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  36.63 
 
 		 506 aa  256  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 505 aa  256  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  34.53 
 
 		 495 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5644  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.84 
 
 		 481 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 502 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 502 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 507 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 498 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  34.56 
 
 		 507 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 502 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 507 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  35.01 
 
 		 488 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  35.43 
 
 		 489 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  35.01 
 
 		 488 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  35.01 
 
 		 488 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  33.73 
 
 		 520 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  35.22 
 
 		 521 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4350  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.64 
 
 		 509 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.62 
 
 		 514 aa  253  5.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 504 aa  253  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.69 
 
 		 507 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 485 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.67 
 
 		 496 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2302  GntR family regulatory protein  39.44 
 
 		 502 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 492 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 506 aa  251  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  36.62 
 
 		 509 aa  250  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 498 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 476 aa  250  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 506 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 506 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  31.99 
 
 		 471 aa  250  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>