278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1270 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1270  putative threonine efflux protein-like  100 
 
 		 227 aa  434  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00299946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4574  putative threonine efflux protein-like protein  91.47 
 
 		 217 aa  313  9e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3794  putative threonine efflux protein-like  91 
 
 		 217 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5731  putative threonine efflux protein-like protein  92.46 
 
 		 199 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4069  putative threonine efflux protein-like protein  87.94 
 
 		 199 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6041  lysine exporter protein LysE/YggA  60.2 
 
 		 199 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5811  lysine exporter protein LysE/YggA  60.2 
 
 		 199 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2508  amino acid transporter LysE  32.12 
 
 		 204 aa  116  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.315866  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  36.68 
 
 		 280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.57 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  32.64 
 
 		 197 aa  113  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  31.12 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  36.7 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  36.7 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  36.7 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  36.7 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  36.7 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  36.7 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3667  lysine exporter protein LysE/YggA  39.51 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127666  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1315  hypothetical protein  35.45 
 
 		 204 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  32.64 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.33 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 		 197 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 		 197 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  32.28 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  36.7 
 
 		 640 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.28 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3848  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.69 
 
 		 200 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4575  lysine exporter protein LysE/YggA  34.69 
 
 		 200 aa  108  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0540942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  31.61 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  31.09 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3696  LysE family translocator protein  34.02 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  31.09 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2824  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.09 
 
 		 197 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00830664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0298  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.05 
 
 		 201 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3939  LysE family translocator protein  34.02 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0257  lysine exporter protein LysE/YggA  34.02 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  34.22 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  33.69 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  33.69 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.67 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6083  amino acid transporter LysE  34.39 
 
 		 201 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  34.21 
 
 		 197 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 203 aa  101  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  34.59 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  32.12 
 
 		 197 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  33.69 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  33.69 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1684  lysine exporter protein LysE/YggA  33.86 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  unclonable  0.0000017661 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  32.62 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  33.15 
 
 		 202 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0374  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.71 
 
 		 201 aa  99.8  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  32.28 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  32.62 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  31.68 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  32.83 
 
 		 202 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  33.51 
 
 		 205 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  31.18 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  31.94 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  33.51 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  31.94 
 
 		 197 aa  95.1  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  32.31 
 
 		 199 aa  95.1  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  32.8 
 
 		 209 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  32.43 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1490  lysine exporter protein LysE/YggA  32.81 
 
 		 198 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  32.64 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3162  lysine exporter protein LysE/YggA  34.76 
 
 		 201 aa  92.8  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  32.98 
 
 		 196 aa  92.8  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1102  lysine exporter protein LysE/YggA  32.09 
 
 		 199 aa  91.3  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2346  hypothetical protein  33.68 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2788  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.66 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2478  hypothetical protein  37.37 
 
 		 198 aa  90.1  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.609748 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000909  putative threonine efflux protein  34.57 
 
 		 194 aa  89.7  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.850609  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06913  putative threonine efflux protein  33.51 
 
 		 199 aa  88.6  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3759  hypothetical protein  37.18 
 
 		 174 aa  88.6  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.444425  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  35.14 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4757  lysine exporter protein LysE/YggA  35.26 
 
 		 203 aa  86.7  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852741  normal  0.0209318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  34.74 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2510  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 209 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2265  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 208 aa  85.5  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.499699  normal  0.537594 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0235  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.88 
 
 		 216 aa  85.1  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0472066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2797  RhtB family transporter  32.98 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.376861  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3096  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  29.79 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423256  normal  0.714667 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2382  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.268756  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1041  transmembrane transporter protein, LysE type translocator  27.6 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1977  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.2 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.019501  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2370  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0414256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.107691  decreased coverage  0.0000842589 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.87 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1213  transporter, LysE family  25.51 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2253  lysine exporter protein LysE/YggA  27.03 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3726  hypothetical protein  31.38 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2454  lysine exporter protein LysE/YggA  27.51 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000409233  normal  0.559989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3106  hypothetical protein  34.96 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>