232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2707 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  100 
 
 
243 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  100 
 
 
243 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  99.18 
 
 
243 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  95.06 
 
 
243 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  95.06 
 
 
243 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  90.95 
 
 
243 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  90.12 
 
 
243 aa  408  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  74.07 
 
 
243 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  74.07 
 
 
243 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  74.07 
 
 
243 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  74.07 
 
 
243 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  75.72 
 
 
243 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  74.07 
 
 
243 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  74.07 
 
 
243 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  74.07 
 
 
243 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  60.49 
 
 
241 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  60.08 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  56.79 
 
 
240 aa  285  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  48.16 
 
 
241 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  52.21 
 
 
241 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  50.68 
 
 
239 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  50.23 
 
 
239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  45.49 
 
 
241 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  46.59 
 
 
241 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  45.63 
 
 
241 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  45.63 
 
 
241 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  45.63 
 
 
241 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  41.7 
 
 
246 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  40.81 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  40.68 
 
 
246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5811  OmpW family protein  37.04 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0168261 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  37.94 
 
 
286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  36.4 
 
 
276 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00001264  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  37.46 
 
 
282 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  36.88 
 
 
276 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  36.88 
 
 
276 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  36.88 
 
 
276 aa  158  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  36.88 
 
 
276 aa  158  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000541983  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  36.88 
 
 
276 aa  158  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000517916  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  36.88 
 
 
276 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  36.88 
 
 
276 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  36.88 
 
 
276 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  37.23 
 
 
274 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  36.16 
 
 
274 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0214  OmpW family protein  35.66 
 
 
277 aa  154  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000152591  unclonable  0.00000000000991303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0238  OmpW family protein  35.27 
 
 
277 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000689668  unclonable  0.0000000000300165 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3410  OmpW family protein  35.27 
 
 
277 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000136478  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0230  OmpW family protein  34.88 
 
 
277 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000579119  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0291  OmpW family protein  34.11 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251819  unclonable  0.0000000000417391 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  34.8 
 
 
274 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2795  OmpW  33.72 
 
 
277 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0311  OmpW family protein  33.72 
 
 
277 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300179  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  32.38 
 
 
274 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  32.74 
 
 
274 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  32.74 
 
 
274 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5178  OmpW family protein  32.38 
 
 
274 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3265  OmpW  32.38 
 
 
274 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5103  OmpW family protein  32.38 
 
 
274 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2010  OmpW family outer membrane protein  34.8 
 
 
274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1875  OmpW family outer membrane protein  34.8 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.253498  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2734  OmpW family outer membrane protein  34.8 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.355181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3131  OmpW family outer membrane protein  34.8 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0901  OmpW family outer membrane protein  34.8 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3168  OmpW family outer membrane protein  34.8 
 
 
290 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3185  OmpW family outer membrane protein  34.56 
 
 
274 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0684356  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2417  OmpW family protein  34.11 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.729819  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2023  OmpW family protein  34.11 
 
 
274 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  0.457638 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  32.8 
 
 
308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  32.4 
 
 
306 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  32.13 
 
 
223 aa  99.4  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2401  putative outer membrane protein  29.6 
 
 
371 aa  98.6  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.675922 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  27.8 
 
 
217 aa  93.6  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2349  OmpW family protein  28.86 
 
 
382 aa  94  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.306712 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  29.44 
 
 
210 aa  92  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  28.4 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  28.57 
 
 
215 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  28.57 
 
 
215 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  29.22 
 
 
210 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  30.09 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  27.64 
 
 
215 aa  89  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  29.39 
 
 
215 aa  88.2  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  29.63 
 
 
210 aa  88.2  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  30.08 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  28.05 
 
 
202 aa  86.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  28.21 
 
 
215 aa  86.3  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  26.14 
 
 
211 aa  85.9  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  27.35 
 
 
214 aa  85.1  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  28.4 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  27.64 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  27.16 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  28.69 
 
 
214 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  26.34 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0194  OmpW  29.82 
 
 
227 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  28.33 
 
 
203 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  26.34 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0319  OmpW  30.29 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.110155  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3286  OmpW family protein  28.24 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  26.34 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  26.64 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  26.42 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>