136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3624 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3624  acyltransferase 3  100 
 
 
389 aa  782    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4099  acyltransferase 3  95.89 
 
 
396 aa  729    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116738  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  30.13 
 
 
377 aa  143  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6655  acyltransferase 3  31.41 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  30.81 
 
 
382 aa  129  9.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  29.31 
 
 
393 aa  127  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6453  acyltransferase 3  30.98 
 
 
363 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292089 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5216  acyltransferase 3  26.12 
 
 
374 aa  116  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0774273  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4804  acyltransferase 3  28.31 
 
 
370 aa  116  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285279  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4566  acyltransferase 3  27.65 
 
 
398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732432  normal  0.281548 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1753  acyltransferase 3  30.87 
 
 
360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220043  normal  0.062316 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  26.21 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3136  acyltransferase 3  29.5 
 
 
361 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6638  acyltransferase 3  27.23 
 
 
370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2034  acyltransferase 3  30.93 
 
 
372 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0544666  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1775  acyltransferase 3  28.69 
 
 
330 aa  102  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1695  acyltransferase 3  27.86 
 
 
353 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.353811  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2500  acyltransferase 3  31.1 
 
 
360 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0570615  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4545  acyltransferase 3  30.33 
 
 
358 aa  97.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1348  acyltransferase 3  27.63 
 
 
366 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558727  decreased coverage  0.000177044 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1748  acyltransferase  26.74 
 
 
346 aa  91.3  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0196433  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1980  acyltransferase 3  26.3 
 
 
352 aa  87  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000357128 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1939  acyltransferase 3  29.47 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0303  acyltransferase 3  28.04 
 
 
368 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0531  acyltransferase 3  26.44 
 
 
342 aa  68.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  25.36 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0602  acyltransferase 3  25.75 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361285  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6708  acyltransferase 3  28.29 
 
 
390 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2032  acyltransferase 3  28.43 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0585091  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2379  acyltransferase-like protein  30.43 
 
 
353 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  43.66 
 
 
353 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  23.32 
 
 
377 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0180  acyltransferase 3  27.13 
 
 
371 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470944  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3098  acyltransferase 3  35.96 
 
 
372 aa  56.6  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0125  acyltransferase 3  25.72 
 
 
433 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  28.34 
 
 
634 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  29.76 
 
 
349 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0961  hypothetical protein  37.04 
 
 
355 aa  54.3  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  25.06 
 
 
636 aa  53.5  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  32.56 
 
 
419 aa  53.5  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  30.77 
 
 
354 aa  53.1  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3909  putative acyltransferase  31.21 
 
 
414 aa  53.1  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400096  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1808  acyltransferase 3  30.93 
 
 
376 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  30.93 
 
 
376 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0091  acyltransferase-like protein  30.2 
 
 
401 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  25.12 
 
 
603 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  25.12 
 
 
603 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  24.33 
 
 
640 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2268  acyltransferase 3  33.67 
 
 
396 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.638322  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  26.8 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  31.82 
 
 
696 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  33.33 
 
 
583 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  36.05 
 
 
392 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1385  acyltransferase 3  27.14 
 
 
635 aa  50.4  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2069  acyltransferase 3  32.58 
 
 
376 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  29.5 
 
 
354 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  31.13 
 
 
407 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  31.13 
 
 
407 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  31.13 
 
 
407 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0988  hypothetical protein  33.65 
 
 
359 aa  49.7  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152683  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  35.06 
 
 
622 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2288  acyltransferase 3  30.7 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  38.75 
 
 
368 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  38.89 
 
 
695 aa  49.3  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1095  acyltransferase 3  31.68 
 
 
381 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  25 
 
 
371 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  27.23 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0243  acyltransferase 3  29.38 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113037  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2299  acyltransferase 3  32.98 
 
 
365 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1071  acyltransferase 3  38.27 
 
 
366 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.710446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5910  acyltransferase 3  32.58 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103949  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10660  predicted acyltransferase  37.04 
 
 
710 aa  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.307211  normal  0.545399 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  31.76 
 
 
353 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  31.37 
 
 
436 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3889  acyltransferase 3  26.92 
 
 
395 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013718 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  24.5 
 
 
350 aa  47.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  38.89 
 
 
658 aa  47.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  32.63 
 
 
404 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1913  acyltransferase 3  37.21 
 
 
356 aa  47.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0890  acyltransferase 3  28.9 
 
 
387 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  24.23 
 
 
654 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  23.85 
 
 
346 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2593  hypothetical protein  31.31 
 
 
409 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.110945  normal  0.12741 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1009  acyltransferase 3  33.65 
 
 
473 aa  46.6  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0379524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  30.77 
 
 
637 aa  46.6  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3508  acyltransferase 3  29.09 
 
 
392 aa  46.2  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  32.43 
 
 
711 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  29.17 
 
 
695 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  32.89 
 
 
658 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  37.5 
 
 
372 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0886  acyltransferase family protein  26.88 
 
 
358 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000218499  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  25.19 
 
 
604 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  29.61 
 
 
367 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  30.11 
 
 
377 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  34.38 
 
 
386 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  32.08 
 
 
356 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  31.43 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0330  acyltransferase 3  32.29 
 
 
397 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.278208 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  32.5 
 
 
679 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0507  acyltransferase 3  26.85 
 
 
312 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>