More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1718 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 316 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  92.09 
 
 		 316 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  99.64 
 
 		 281 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  92.09 
 
 		 316 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  93.95 
 
 		 281 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  94.66 
 
 		 281 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  89.32 
 
 		 281 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  80.57 
 
 		 568 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  80.57 
 
 		 454 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  81.14 
 
 		 281 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  81.14 
 
 		 281 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  81.14 
 
 		 281 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  81.14 
 
 		 281 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  81.14 
 
 		 281 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  80.43 
 
 		 281 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  79.5 
 
 		 279 aa  448  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  80.58 
 
 		 279 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  77.7 
 
 		 279 aa  441  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  63.64 
 
 		 307 aa  348  6e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  62.68 
 
 		 284 aa  345  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  61.43 
 
 		 310 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  70.09 
 
 		 285 aa  330  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  61.07 
 
 		 285 aa  329  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  55.76 
 
 		 276 aa  296  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  56.27 
 
 		 281 aa  278  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  52.61 
 
 		 302 aa  263  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  61.4 
 
 		 235 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0913  phosphoserine phosphatase SerB  54.26 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.697374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  59.46 
 
 		 279 aa  251  8.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  63.55 
 
 		 296 aa  249  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  57.21 
 
 		 241 aa  247  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  61.76 
 
 		 237 aa  242  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  57.48 
 
 		 236 aa  242  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  57.67 
 
 		 236 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  57.21 
 
 		 237 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  53.62 
 
 		 237 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  53.18 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  52.31 
 
 		 264 aa  223  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  54.88 
 
 		 237 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  44.94 
 
 		 278 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2506  phosphoserine phosphatase SerB  55.81 
 
 		 238 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  50.43 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3159  phosphoserine phosphatase  55.81 
 
 		 238 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  49.32 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  47.18 
 
 		 418 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  47.58 
 
 		 418 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  49.51 
 
 		 410 aa  196  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  44.96 
 
 		 369 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  47.75 
 
 		 410 aa  194  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  49.1 
 
 		 412 aa  193  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  45.73 
 
 		 410 aa  192  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  50.49 
 
 		 404 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  40 
 
 		 405 aa  192  8e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  41.36 
 
 		 405 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  46.46 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  46.78 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  46.58 
 
 		 326 aa  190  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  48 
 
 		 438 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  50.49 
 
 		 415 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  46.37 
 
 		 429 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  50.49 
 
 		 404 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  50.49 
 
 		 404 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  44.26 
 
 		 280 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  45.16 
 
 		 404 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  46.37 
 
 		 429 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  47.77 
 
 		 411 aa  186  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  43.06 
 
 		 405 aa  186  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  45.56 
 
 		 404 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  43.06 
 
 		 405 aa  186  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  49.25 
 
 		 292 aa  185  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  46.58 
 
 		 328 aa  185  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  48.54 
 
 		 398 aa  185  9e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  43.34 
 
 		 404 aa  185  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  50 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  47.78 
 
 		 289 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  45.27 
 
 		 406 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  50.49 
 
 		 372 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  47.14 
 
 		 404 aa  182  6e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  44.72 
 
 		 432 aa  182  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  49.02 
 
 		 325 aa  182  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  50.49 
 
 		 327 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  47.95 
 
 		 404 aa  181  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  45.33 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  42.31 
 
 		 322 aa  179  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  46.63 
 
 		 398 aa  178  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  51 
 
 		 419 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  48.04 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  48.04 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  48.04 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  50.24 
 
 		 296 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  48.04 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  48.04 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  48.04 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  48.04 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  48.04 
 
 		 325 aa  176  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  48.04 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  46.12 
 
 		 400 aa  176  4e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  48.31 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  43.7 
 
 		 400 aa  176  5e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  42.21 
 
 		 357 aa  176  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>