More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0706 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0706  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 328 aa  660    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0723  LysR family transcriptional regulator  97.26 
 
 		 328 aa  621  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.562943 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0826  LysR family transcriptional regulator  85.63 
 
 		 327 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.325124  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3919  LysR family transcriptional regulator  86.24 
 
 		 327 aa  535  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0343  LysR family transcriptional regulator  85.63 
 
 		 327 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0796  LysR family transcriptional regulator  84.4 
 
 		 325 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2557  LysR family transcriptional regulator  81.09 
 
 		 327 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3206  LysR family transcriptional regulator  65.44 
 
 		 326 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000350263  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2049  LysR family transcriptional regulator  65.44 
 
 		 326 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535454  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1914  LysR family transcriptional regulator  65.44 
 
 		 326 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00000121317  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3220  LysR family transcriptional regulator  65.44 
 
 		 326 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000114793  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1403  LysR family transcriptional regulator  65.14 
 
 		 326 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000041163  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0864  LysR family transcriptional regulator  65.44 
 
 		 326 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3167  LysR family transcriptional regulator  65.44 
 
 		 326 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000529291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2696  LysR family transcriptional regulator  61.94 
 
 		 288 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2428  LysR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 329 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.886071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1227  LysR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 312 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207252 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5689  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 307 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4615  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 307 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0591659 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3753  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 307 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2140  transcriptional regulator, LysR family  38.38 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3128  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 349 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3147  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315246 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3069  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2518  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3131  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154836  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3186  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651713  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6482  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 349 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.833038 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2811  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 351 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0138  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 351 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 351 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 351 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2270  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 351 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520231  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0153  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 351 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0145  transcriptional regulator  37.67 
 
 		 351 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 351 aa  202  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0031  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0305  transcriptional regulator, LysR family  35.35 
 
 		 367 aa  195  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4420  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 367 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0287989 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0065  transcription regulator protein  37.07 
 
 		 312 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3684  transcriptional regulator, LysR family  37.76 
 
 		 312 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1971  LysR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3361  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 312 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2289  transcriptional regulator, LysR family  37.79 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2586  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2712  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 295 aa  188  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2690  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2661  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 295 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.583907  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2050  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 295 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4973  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0104  LysR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1581  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  37.97 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3766  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 306 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368429  normal  0.290887 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1192  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000735562  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5996  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.48899 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3570  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 310 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0936  transcriptional regulator  36.19 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1701  LysR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1855  transcriptional regulator  36.19 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0750  LysR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.63163  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6527  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1469  LysR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0412  LysR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2342  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4606  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3757  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5752  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.515576 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  36.39 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5327  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0620404 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6676  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 316 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.454387  normal  0.341133 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1679  LysR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6200  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 316 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0503075 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1347  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 312 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.336134 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5833  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 316 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0237  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 		 355 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 313 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1332  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 313 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601876  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1371  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 313 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3634  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10730  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04020  Transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.010464  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2624  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210848  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5488  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 306 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2088  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.320314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2317  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0276  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 571 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0831  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 296 aa  169  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01980  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.445097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4595  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489457  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  36.61 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  35.12 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>