More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5916 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5916  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 310 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0826034  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7389  KpsF/GutQ  93.55 
 
 		 310 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6185  KpsF/GutQ family protein  99.66 
 
 		 291 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1362  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  74.59 
 
 		 333 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3211  KpsF/GutQ family sugar isomerase  73.7 
 
 		 311 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3262  arabinose-5-phosphate isomerase  73.7 
 
 		 351 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3249  KpsF/GutQ family sugar isomerase  73.7 
 
 		 311 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.212815  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6257  KpsF/GutQ family protein  65.58 
 
 		 311 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0503  KpsF/GutQ family protein  58.14 
 
 		 311 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0918  polysialic acid capsule expression protein, KpsF/GutQ family protein  51.96 
 
 		 321 aa  319  3.9999999999999996e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5735  D-arabinose 5-phosphate isomerase  55.52 
 
 		 320 aa  318  6e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0294  arabinose-5-phosphate isomerase  51.15 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1437  arabinose-5-phosphate isomerase  49.84 
 
 		 315 aa  311  6.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.743757  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1617  arabinose-5-phosphate isomerase  49.19 
 
 		 315 aa  311  7.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1778  arabinose-5-phosphate isomerase  49.19 
 
 		 315 aa  309  5e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.458122  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1393  KpsF/GutQ family protein  51.62 
 
 		 310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  51.62 
 
 		 310 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1123  KpsF/GutQ family protein  50.17 
 
 		 342 aa  300  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  52.82 
 
 		 321 aa  298  6e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1806  KpsF/GutQ family protein  51.13 
 
 		 317 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.172857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  51.62 
 
 		 324 aa  288  9e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  53.55 
 
 		 333 aa  287  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  53.62 
 
 		 339 aa  286  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 321 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  55.03 
 
 		 333 aa  285  5.999999999999999e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0617  KpsF/GutQ family protein  48.32 
 
 		 319 aa  285  5.999999999999999e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.851934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  51.99 
 
 		 324 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  51.99 
 
 		 324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001785  arabinose 5-phosphate isomerase  48.52 
 
 		 329 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  51.66 
 
 		 324 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  49.02 
 
 		 331 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  51.77 
 
 		 326 aa  282  5.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  51.62 
 
 		 326 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  53.4 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  50.34 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  50.99 
 
 		 344 aa  280  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  51.32 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  50.84 
 
 		 322 aa  279  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  50.81 
 
 		 345 aa  279  5e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  50.81 
 
 		 345 aa  278  6e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  53.38 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  53.16 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  50.97 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  48.87 
 
 		 323 aa  277  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  49.35 
 
 		 323 aa  276  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  50.17 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  49.33 
 
 		 321 aa  276  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  49.84 
 
 		 329 aa  275  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  49.34 
 
 		 323 aa  275  9e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  50.16 
 
 		 324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  49.66 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  50.5 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50 
 
 		 328 aa  272  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  50.49 
 
 		 324 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50 
 
 		 357 aa  272  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50 
 
 		 342 aa  272  5.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.67 
 
 		 328 aa  272  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  51.53 
 
 		 329 aa  271  8.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3418  KpsF/GutQ  53.36 
 
 		 332 aa  271  9e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000032508  normal  0.585789 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  47.12 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  47.12 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.51 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  49.51 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.51 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.51 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  49.51 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  48.54 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.51 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.51 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.51 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.51 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  49.34 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  48.37 
 
 		 323 aa  269  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  47.87 
 
 		 321 aa  269  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  46.98 
 
 		 326 aa  268  8e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.35 
 
 		 328 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3339  KpsF/GutQ family protein  52.48 
 
 		 326 aa  268  8.999999999999999e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  50.65 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.35 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.35 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  52.92 
 
 		 335 aa  267  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.35 
 
 		 328 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  48.68 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.35 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0822  KpsF/GutQ family protein  49.01 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0538  capsule expression protein KpsF/GutQ  53.49 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  47.51 
 
 		 320 aa  267  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  48.68 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.35 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  48.68 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  45.39 
 
 		 315 aa  267  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0335  KpsF/GutQ family protein  49.51 
 
 		 334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00223142  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  51.48 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  53.04 
 
 		 332 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  51.32 
 
 		 330 aa  266  4e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3219  polysialic acid capsule expression protein KpsF  46.53 
 
 		 339 aa  266  5e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  51.52 
 
 		 327 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0770  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  53.22 
 
 		 327 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0602  KpsF/GutQ family sugar isomerase  53.22 
 
 		 327 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0071  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  53.22 
 
 		 327 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>