More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5907 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  51.75 
 
 		 751 aa  740    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  100 
 
 		 745 aa  1508    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  75.68 
 
 		 746 aa  1066    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  47.44 
 
 		 750 aa  639    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  91.41 
 
 		 745 aa  1327    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2866  exopolysaccharide transporter  55.33 
 
 		 764 aa  777    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  58.01 
 
 		 746 aa  861    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  75.27 
 
 		 746 aa  1062    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  49.32 
 
 		 757 aa  683    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  98.93 
 
 		 745 aa  1493    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  75.68 
 
 		 746 aa  1064    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  75.68 
 
 		 746 aa  1065    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  46.62 
 
 		 740 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  45.88 
 
 		 755 aa  627  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  43.36 
 
 		 747 aa  617  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  44.83 
 
 		 746 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  48.09 
 
 		 755 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  44.14 
 
 		 740 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  43.81 
 
 		 747 aa  597  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  43.41 
 
 		 748 aa  596  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  46.05 
 
 		 747 aa  596  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  44.75 
 
 		 734 aa  591  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  43.73 
 
 		 740 aa  582  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  46.37 
 
 		 747 aa  579  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  42.49 
 
 		 764 aa  575  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  45.09 
 
 		 726 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  41.51 
 
 		 736 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  40.61 
 
 		 736 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  40.77 
 
 		 744 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  41.92 
 
 		 744 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  39.91 
 
 		 741 aa  519  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  41.63 
 
 		 744 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  40.68 
 
 		 730 aa  499  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  39.7 
 
 		 747 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  40.11 
 
 		 746 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  37.97 
 
 		 759 aa  484  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  38.61 
 
 		 740 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  41.73 
 
 		 755 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  38.99 
 
 		 734 aa  485  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  39.43 
 
 		 745 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4097  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  41.02 
 
 		 760 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  37.95 
 
 		 749 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  40.68 
 
 		 754 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3622  hypothetical protein  40.42 
 
 		 760 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  37.82 
 
 		 735 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.95 
 
 		 741 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  37.95 
 
 		 741 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  35.59 
 
 		 721 aa  459  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  36.29 
 
 		 723 aa  457  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  37.95 
 
 		 741 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  36.74 
 
 		 753 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  37.23 
 
 		 739 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  38.17 
 
 		 741 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  38.03 
 
 		 741 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.96 
 
 		 741 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  37.09 
 
 		 739 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  37.68 
 
 		 741 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  36.96 
 
 		 739 aa  452  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  36.96 
 
 		 739 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  36.54 
 
 		 732 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  37.52 
 
 		 740 aa  446  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  36.15 
 
 		 731 aa  444  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  37.01 
 
 		 726 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.46 
 
 		 736 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  36.24 
 
 		 723 aa  439  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.1 
 
 		 730 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  34.58 
 
 		 720 aa  431  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  35.35 
 
 		 724 aa  428  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  34.26 
 
 		 716 aa  429  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  34.45 
 
 		 719 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  34.13 
 
 		 727 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  34.49 
 
 		 719 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  34.69 
 
 		 720 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  34.32 
 
 		 719 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  34.32 
 
 		 719 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  34.65 
 
 		 720 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  34.65 
 
 		 720 aa  413  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  34.65 
 
 		 720 aa  413  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  34.65 
 
 		 720 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  34.51 
 
 		 720 aa  413  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2632  non-specific protein-tyrosine kinase  35.08 
 
 		 745 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.405291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  33.38 
 
 		 722 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  34.45 
 
 		 719 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  34.51 
 
 		 720 aa  411  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  34.51 
 
 		 720 aa  412  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  33.47 
 
 		 724 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  32.6 
 
 		 726 aa  392  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  32.6 
 
 		 726 aa  392  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  32.74 
 
 		 726 aa  392  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  32.6 
 
 		 726 aa  392  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  32.6 
 
 		 726 aa  392  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  32.6 
 
 		 726 aa  392  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  32.6 
 
 		 726 aa  392  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  32.6 
 
 		 726 aa  392  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  32.03 
 
 		 726 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  36.18 
 
 		 721 aa  379  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  30.75 
 
 		 802 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  31.67 
 
 		 784 aa  340  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  31.16 
 
 		 784 aa  334  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  33.15 
 
 		 733 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>