234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4882 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  99.05 
 
 		 210 aa  420  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0757  hypothetical protein  88.41 
 
 		 207 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482457  hitchhiker  0.00142809 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5353  hypothetical protein  84.47 
 
 		 230 aa  350  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00600694  normal  0.075763 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3433  hypothetical protein  84.47 
 
 		 230 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4935  hypothetical protein  84.47 
 
 		 230 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000188472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  34.05 
 
 		 189 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  30 
 
 		 192 aa  85.5  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3069  protein of unknown function DUF218  35.19 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000320027 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  28.65 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2611  hypothetical protein  30.82 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3132  protein of unknown function DUF218  39.2 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  29.34 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  29.29 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6010  hypothetical protein  39.64 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0036076  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4868  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3447  hypothetical protein  29.45 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2325  hypothetical protein  31.95 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2008  hypothetical protein  27.97 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  24.73 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4671  hypothetical protein  30.22 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.0210644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0471  protein of unknown function DUF218  30.91 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  26.89 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  26.4 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0298  protein of unknown function DUF218  34.51 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1036  protein of unknown function DUF218  36.75 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  28.44 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  30.63 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  33.06 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  28.82 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1706  protein of unknown function DUF218  31.25 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.080419  hitchhiker  1.73003e-16 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0469  protein of unknown function DUF218  35.77 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  29.91 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  29.69 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04460  uncharacterized membrane protein  33.53 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  29.3 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3216  protein of unknown function DUF218  28.83 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101173  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  35.71 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0430  hypothetical protein  26.22 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  25.86 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0466  protein of unknown function DUF218  34.82 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  26.67 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  27.34 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  27.34 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  28.12 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  27.34 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  27.34 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  27.75 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  22.78 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0746  protein of unknown function DUF218  28.78 
 
 		 370 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  26.95 
 
 		 342 aa  58.9  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  28.91 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  28.91 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  27.72 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  29.05 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  27.03 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  27.96 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  27.03 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0832  hypothetical protein  24.22 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000170655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  33.68 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  26.25 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  26.21 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  30 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13720  hypothetical protein  29.75 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.195466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1272  protein of unknown function DUF218  30.77 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  26.67 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  28.26 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1950  hypothetical protein  28.93 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  25.78 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  26.06 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  33.68 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1772  hypothetical protein  27.97 
 
 		 375 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000657641  normal  0.0639898 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  27.85 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1601  hypothetical protein  27.97 
 
 		 375 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1496  hypothetical protein  27.97 
 
 		 375 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  25.22 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  28.12 
 
 		 263 aa  54.3  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  25.22 
 
 		 178 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  25.33 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  22.3 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  32 
 
 		 255 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  32 
 
 		 255 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0558  hypothetical protein  30.92 
 
 		 153 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  30.97 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0878  hypothetical protein  29.63 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  24.83 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  22.3 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0895  hypothetical protein  29.63 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  32 
 
 		 255 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  32 
 
 		 255 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  32 
 
 		 255 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0884  hypothetical protein  29.63 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.150087  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  32 
 
 		 255 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  32 
 
 		 255 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0069  protein of unknown function DUF218  27.54 
 
 		 333 aa  53.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  34.41 
 
 		 255 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  22.3 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1691  hypothetical protein  34.71 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0187033  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  26.56 
 
 		 185 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  25 
 
 		 345 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>