133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0092 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0092  transposase  100 
 
 
120 aa  246  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1038  integrase catalytic region  62.37 
 
 
488 aa  124  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5194  integrase catalytic subunit  61.11 
 
 
525 aa  121  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6206  integrase catalytic region  57.78 
 
 
518 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4730  integrase catalytic region  57.78 
 
 
518 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5628  integrase catalytic region  57.78 
 
 
518 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6260  integrase catalytic subunit  54.44 
 
 
517 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.441371  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2289  integrase catalytic region  53.33 
 
 
516 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4798  integrase catalytic region  53.33 
 
 
516 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288871  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1795  putative transposase  51.11 
 
 
517 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765121  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4696  integrase catalytic subunit  53.33 
 
 
505 aa  103  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4229  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 
514 aa  94.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0193  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 
514 aa  94.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0410  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 
514 aa  94.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0752835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0598  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 
514 aa  94.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0997  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 
514 aa  94.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1628  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 
514 aa  94.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1852  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 
514 aa  94.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2396  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 
514 aa  94.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2982  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 
514 aa  95.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00424027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3180  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 
514 aa  94.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.150597  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1855  integrase catalytic subunit  46.67 
 
 
507 aa  94.4  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3594  integrase catalytic subunit  46.67 
 
 
514 aa  94  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1938  integrase catalytic subunit  50 
 
 
512 aa  92.8  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.441696  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2256  integrase catalytic subunit  45.05 
 
 
514 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0988  integrase catalytic subunit  46.67 
 
 
513 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1299  integrase catalytic subunit  46.67 
 
 
513 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2660  integrase catalytic subunit  46.67 
 
 
513 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3187  integrase catalytic subunit  46.67 
 
 
513 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3708  integrase catalytic subunit  46.67 
 
 
513 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02341  hypothetical protein  43.96 
 
 
539 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1075  integrase catalytic subunit  46.67 
 
 
475 aa  91.3  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0892  integrase catalytic subunit  46.67 
 
 
513 aa  90.9  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00182  transposase  43.96 
 
 
510 aa  90.5  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01935  hypothetical protein  43.96 
 
 
510 aa  90.5  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06058  hypothetical protein  43.96 
 
 
510 aa  90.5  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06964  hypothetical protein  43.96 
 
 
510 aa  90.5  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4128  integrase catalytic subunit  45.56 
 
 
513 aa  90.1  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1224  integrase catalytic subunit  45.56 
 
 
513 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4290  integrase catalytic subunit  46.67 
 
 
512 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.559076  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4396  integrase catalytic subunit  46.67 
 
 
512 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624598  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4788  integrase catalytic subunit  46.67 
 
 
512 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1554  integrase catalytic subunit  43.96 
 
 
519 aa  89  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2053  integrase catalytic subunit  43.96 
 
 
519 aa  89  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3414  integrase catalytic subunit  43.96 
 
 
519 aa  89  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604761  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5452  integrase catalytic region  44.44 
 
 
458 aa  88.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3399  integrase catalytic subunit  47.78 
 
 
515 aa  87.8  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.976382  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3485  integrase catalytic subunit  47.78 
 
 
515 aa  87.8  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.522877  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0283  integrase catalytic subunit  47.78 
 
 
515 aa  87.8  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.188339  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2303  integrase catalytic subunit  47.78 
 
 
515 aa  87.8  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.268136  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5413  integrase catalytic region  44.44 
 
 
385 aa  87.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.694464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2841  ISPsy14, transposase  44.44 
 
 
504 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0126762  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  41.94 
 
 
507 aa  84.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  41.94 
 
 
507 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1811  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
510 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14945  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3593  integrase catalytic subunit  42.22 
 
 
513 aa  82.8  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal  0.454266 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1328  integrase catalytic subunit  39.56 
 
 
513 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1250  integrase catalytic subunit  39.56 
 
 
513 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3716  Integrase catalytic region  43.33 
 
 
523 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2120  Integrase catalytic region  42.53 
 
 
513 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3293  Integrase catalytic region  42.53 
 
 
513 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823799  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3092  Integrase catalytic region  42.53 
 
 
513 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30832  normal  0.801547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3694  Integrase catalytic region  42.53 
 
 
513 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00066117  hitchhiker  0.00045424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3788  Integrase catalytic region  42.53 
 
 
513 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2154  Integrase catalytic region  42.53 
 
 
513 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.944811  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4234  Integrase catalytic region  42.53 
 
 
513 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2963  Integrase catalytic region  42.53 
 
 
513 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2788  Integrase catalytic region  42.53 
 
 
513 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.952319  normal  0.0224954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4302  Integrase catalytic region  42.53 
 
 
513 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0850  Integrase catalytic region  42.53 
 
 
513 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6163  Integrase catalytic region  42.53 
 
 
513 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5580  Integrase catalytic region  42.53 
 
 
513 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6473  Integrase catalytic region  42.53 
 
 
513 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4851  Integrase catalytic region  42.53 
 
 
513 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242832  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5321  Integrase catalytic region  42.53 
 
 
513 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6805  Integrase catalytic region  42.53 
 
 
513 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6980  Integrase catalytic region  42.53 
 
 
513 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2548  integrase catalytic subunit  39.77 
 
 
518 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1463  transposase  40 
 
 
487 aa  76.6  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4138  integrase catalytic subunit  37.36 
 
 
513 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5654  Integrase catalytic region  40 
 
 
512 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3740  putative transposase  36.67 
 
 
512 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0612  integrase catalytic subunit  37.5 
 
 
472 aa  71.2  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352245  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2791  TRm23a transposase  37.5 
 
 
260 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.297528  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0706  integrase catalytic region  37.78 
 
 
528 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00978905  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0080  transposase subunit  90.91 
 
 
45 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901152  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0559  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
517 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0780  Integrase catalytic region  32.97 
 
 
432 aa  62  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0303  integrase catalytic subunit  32.95 
 
 
519 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2132  integrase catalytic subunit  32.95 
 
 
519 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3016  integrase catalytic subunit  32.95 
 
 
519 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9835  transposase  32.95 
 
 
517 aa  60.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0037  Integrase catalytic region  34.09 
 
 
515 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1830  transposase subunit  32.5 
 
 
526 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3873  Integrase catalytic region  28.74 
 
 
531 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464732  normal  0.0452112 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1429  integrase catalytic subunit  33.75 
 
 
524 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.398273  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1482  integrase catalytic subunit  33.75 
 
 
524 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1925  integrase catalytic subunit  33.75 
 
 
524 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.683538  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2241  integrase catalytic subunit  33.75 
 
 
524 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0638  Integrase catalytic region  30 
 
 
504 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.316321  normal  0.0202803 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>