11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0080 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0080  transposase subunit  100 
 
 
45 aa  94  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901152  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0092  transposase  90.91 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1038  integrase catalytic region  57.5 
 
 
488 aa  47  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6206  integrase catalytic region  64.52 
 
 
518 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4730  integrase catalytic region  64.52 
 
 
518 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5628  integrase catalytic region  64.52 
 
 
518 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5194  integrase catalytic subunit  60 
 
 
525 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2289  integrase catalytic region  54.29 
 
 
516 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4798  integrase catalytic region  54.29 
 
 
516 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288871  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1795  putative transposase  53.12 
 
 
517 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765121  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4696  integrase catalytic subunit  52.78 
 
 
505 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.569862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>