More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2003 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  100 
 
 		 222 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  86.39 
 
 		 192 aa  329  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  86.39 
 
 		 192 aa  329  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  85.79 
 
 		 191 aa  322  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  84.74 
 
 		 193 aa  318  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  83.68 
 
 		 191 aa  318  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  82.2 
 
 		 192 aa  315  4e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  81.68 
 
 		 191 aa  310  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  69.63 
 
 		 193 aa  267  8e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  65.61 
 
 		 197 aa  258  7e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  65.61 
 
 		 197 aa  258  7e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  65.96 
 
 		 194 aa  256  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  65.61 
 
 		 197 aa  255  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  64.36 
 
 		 196 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  64.36 
 
 		 196 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  64.36 
 
 		 196 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  62.83 
 
 		 198 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  56.38 
 
 		 196 aa  227  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  56.38 
 
 		 196 aa  227  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  56.38 
 
 		 196 aa  227  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  56.38 
 
 		 196 aa  227  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  55.85 
 
 		 196 aa  226  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  55.85 
 
 		 196 aa  225  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  55.85 
 
 		 196 aa  225  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  55.85 
 
 		 196 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  55.85 
 
 		 196 aa  224  8e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  50.27 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  48.92 
 
 		 192 aa  175  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  47.22 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  46.11 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  45.16 
 
 		 189 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  41.62 
 
 		 190 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  41.08 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  39.57 
 
 		 202 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  39.78 
 
 		 318 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  36.61 
 
 		 188 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  36.07 
 
 		 190 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  36.07 
 
 		 187 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  38.92 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  37.63 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  39.36 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  45.64 
 
 		 189 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  37.3 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  37.3 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  41.05 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  41.05 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  34.04 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  38.38 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  34.04 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  38.25 
 
 		 186 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  36.81 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  36.59 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 180 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  37.16 
 
 		 235 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 189 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 195 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  30.89 
 
 		 188 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  35.16 
 
 		 188 aa  101  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  33.9 
 
 		 193 aa  102  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  32.62 
 
 		 197 aa  101  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  37.97 
 
 		 194 aa  101  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  32.37 
 
 		 198 aa  101  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  38.17 
 
 		 188 aa  101  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  36.56 
 
 		 188 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  37.57 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  35.05 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  37.16 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  37.16 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  37.16 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  33.68 
 
 		 195 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  37.16 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  36.7 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  36.61 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  36.61 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  36.17 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  36.61 
 
 		 186 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  37.16 
 
 		 186 aa  99.4  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  35.16 
 
 		 193 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  36.22 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  34.07 
 
 		 180 aa  99.4  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  38.25 
 
 		 186 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  38.25 
 
 		 186 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  36.02 
 
 		 187 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  36.76 
 
 		 190 aa  98.6  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  35.52 
 
 		 188 aa  98.6  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 184 aa  98.2  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  38.04 
 
 		 182 aa  98.2  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  33.52 
 
 		 192 aa  98.2  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  34.07 
 
 		 184 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6401  resolvase domain-containing protein  30.65 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  38.17 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  34.62 
 
 		 197 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  32.96 
 
 		 184 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  34.25 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  35.52 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  35.36 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  35.52 
 
 		 185 aa  97.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  34.05 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>