83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2116 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  537  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  98.85 
 
 		 647 aa  540  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  88.51 
 
 		 259 aa  471  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  67.32 
 
 		 257 aa  350  8.999999999999999e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  59.6 
 
 		 259 aa  324  1e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  62.03 
 
 		 277 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  61.39 
 
 		 274 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  62.76 
 
 		 269 aa  308  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  62.72 
 
 		 272 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  56.15 
 
 		 265 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  55.6 
 
 		 261 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  56.03 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  57.14 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  54.8 
 
 		 257 aa  261  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  53.82 
 
 		 261 aa  259  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  50.78 
 
 		 255 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  57.2 
 
 		 264 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  53.82 
 
 		 271 aa  248  8e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  53.88 
 
 		 258 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  53.05 
 
 		 283 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  55.7 
 
 		 252 aa  240  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  55.76 
 
 		 272 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  55.27 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  54.87 
 
 		 265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  50.43 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  49.56 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  48.62 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  45.56 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  42.69 
 
 		 256 aa  198  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  46.4 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  44.72 
 
 		 247 aa  188  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  47.48 
 
 		 252 aa  185  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  46.09 
 
 		 248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  42.15 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  41.6 
 
 		 251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  46.5 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  36.55 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  42.32 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  36.71 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  41.39 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  34.01 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  34.6 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  31.6 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  31.6 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  26.19 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.11 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  29.35 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  23.63 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  30.71 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  26.07 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  27.97 
 
 		 274 aa  52.4  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  24.89 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  29 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13000  hypothetical protein  32.35 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  24 
 
 		 274 aa  48.9  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  25.78 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  26.32 
 
 		 408 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  26.46 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0893  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.84 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 364 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.7 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  28.47 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  24.64 
 
 		 423 aa  47  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 		 275 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  23.72 
 
 		 415 aa  46.2  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 		 364 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.45 
 
 		 371 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  43.06 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  23.35 
 
 		 397 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  30 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1067  hypothetical protein  35.29 
 
 		 145 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0889291  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  31 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  26.79 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  36.45 
 
 		 413 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  37.68 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.02 
 
 		 370 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  25.63 
 
 		 410 aa  43.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.13 
 
 		 370 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  31.63 
 
 		 402 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  32.75 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  26.09 
 
 		 323 aa  42.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3228  Acylglycerol lipase  32.95 
 
 		 255 aa  42  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000428339  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>