247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0680 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0680  rarD protein  100 
 
 		 306 aa  603  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.667831  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0672  RarD protein  98.95 
 
 		 290 aa  559  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2608  transporter DMT superfamily protein  86.93 
 
 		 325 aa  532  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0719  transporter DMT superfamily protein  54.03 
 
 		 313 aa  325  7e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0071  rarD protein  55.25 
 
 		 311 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0970  transporter DMT superfamily protein  54.82 
 
 		 306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0101189  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3520  rarD protein  54.61 
 
 		 296 aa  299  5e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194559 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1178  RarD protein, DMT superfamily transporter  51.51 
 
 		 304 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1030  RarD protein, DMT superfamily transporter  51.51 
 
 		 305 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1476  hypothetical protein  50.33 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3228  hypothetical protein  50.66 
 
 		 317 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4067  transporter DMT superfamily protein  51.5 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3340  RarD family protein  51.5 
 
 		 299 aa  248  8e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  45.21 
 
 		 335 aa  238  8e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  44.1 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  44.03 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  39.6 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.48 
 
 		 298 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.73 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  42 
 
 		 307 aa  222  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.33 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  41.2 
 
 		 308 aa  219  6e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  42 
 
 		 307 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1952  rarD protein  41.96 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  41.16 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  38.89 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0570  hypothetical protein  42.66 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0717  transporter DMT superfamily protein  40.07 
 
 		 294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.424655  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  38.13 
 
 		 300 aa  216  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  40.69 
 
 		 294 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0334  transporter DMT superfamily protein  41.22 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.21 
 
 		 295 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  39.45 
 
 		 315 aa  215  8e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.4 
 
 		 306 aa  215  9e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  42.86 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  39.58 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  42.86 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1247  transporter DMT superfamily protein  38.75 
 
 		 316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  0.0239516 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.97 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  37.11 
 
 		 304 aa  212  7e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  42.81 
 
 		 297 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  37.04 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.62 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0807  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.67 
 
 		 301 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00187361  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1428  rarD protein  41.18 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.242387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0811  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.67 
 
 		 301 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0657773  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  40.69 
 
 		 301 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  39.31 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  38.97 
 
 		 313 aa  209  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  38.68 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  37.85 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  37.85 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  37.85 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  37.85 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  40.14 
 
 		 295 aa  209  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  37.85 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0760  hypothetical protein  45.3 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  38.28 
 
 		 313 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1207  rarD protein  37.2 
 
 		 319 aa  209  6e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  36.15 
 
 		 305 aa  209  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1183  DMT superfamily efflux pump, RarD  36.61 
 
 		 319 aa  207  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  37.97 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  40 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  35.49 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  37.93 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  36.99 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  38.41 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4844  transporter DMT superfamily protein  44.25 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000446481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0891  transporter DMT superfamily protein  41.75 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  37.11 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1110  transporter DMT superfamily protein  43.4 
 
 		 313 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  36.86 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  36.86 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  36.86 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4018  rarD protein  42.05 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3201  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.52 
 
 		 333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.510387 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  40 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0706  RarD protein  40.88 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3544  RarD protein  41.45 
 
 		 304 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.63 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  38.19 
 
 		 295 aa  200  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  38.63 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  38.63 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  38.63 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2967  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.31 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.895178 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  38.63 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  39.24 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  39.24 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0936  rarD protein  39.86 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  40.14 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  39.24 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00198  Conserved membrane protein RarD  38.7 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493256  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0778  RarD protein  34.35 
 
 		 290 aa  197  3e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  37.07 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  37.85 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  39.45 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2949  transporter DMT superfamily protein  42.21 
 
 		 295 aa  196  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  35.74 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  35.74 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  35.74 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>