44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0071 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  86.43 
 
 		 272 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  38.64 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  39.15 
 
 		 264 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  37.71 
 
 		 261 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  38.89 
 
 		 278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  37.6 
 
 		 267 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  34.47 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  37.23 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  35 
 
 		 327 aa  109  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  36.28 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  43.85 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  35.21 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  35.71 
 
 		 268 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  29.02 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  32.18 
 
 		 241 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  28.3 
 
 		 245 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  28.29 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4216  hypothetical protein  31.96 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3892  hypothetical protein  29.06 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0691561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  31.95 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  33.2 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  33.2 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  27.88 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  31.51 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  34.83 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  31.63 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  31.47 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  30.12 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1073  hypothetical protein  38.89 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245832 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  27.75 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  31.14 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  28.29 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  27.56 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0177  hypothetical protein  30.88 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.23071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  28.57 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  28.74 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  31.91 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  34.25 
 
 		 259 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  29.63 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  28.91 
 
 		 254 aa  48.9  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  34.12 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  28.43 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3996  hypothetical protein  29.19 
 
 		 195 aa  43.5  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>