90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0257 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1598  chemotaxis protein cheW  100 
 
 
244 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1401  chemotaxis protein cheW  100 
 
 
244 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2539  CheW domain-containing protein  100 
 
 
244 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155706  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0257  chemotaxis protein cheW  100 
 
 
244 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2684  CheW domain-containing protein  97.15 
 
 
246 aa  430  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0504  chemotaxis protein cheW  90.16 
 
 
239 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0965  chemotaxis protein cheW  99.5 
 
 
201 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0220  chemotaxis protein cheW  99.5 
 
 
201 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.981977  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4573  CheW protein  61.37 
 
 
233 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468736  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3790  CheW protein  61.37 
 
 
233 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3734  CheW protein  61.37 
 
 
233 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2305  CheW protein  59.59 
 
 
235 aa  274  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5516  CheW protein  57.89 
 
 
240 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334912  normal  0.661174 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3682  CheW protein  57.6 
 
 
238 aa  269  3e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358535  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4943  CheW protein  58.75 
 
 
247 aa  262  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318865  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5392  CheW protein  58.62 
 
 
233 aa  242  4e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3976  CheW protein  51.07 
 
 
226 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16460  CheW domain-containing protein  37.83 
 
 
229 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3970  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  37.9 
 
 
250 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000212039  hitchhiker  0.0041707 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3650  CheW protein  38.96 
 
 
225 aa  145  4e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107896  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2030  CheW protein  30.83 
 
 
253 aa  138  9e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2056  CheW protein  30.83 
 
 
253 aa  138  9e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1524  CheW protein  30.26 
 
 
246 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4231  putative CheW protein  36.52 
 
 
221 aa  135  7e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1432  hypothetical protein  37.39 
 
 
229 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320082  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1491  CheW domain-containing protein  36.52 
 
 
215 aa  134  1e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000195231  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4127  CheW protein  37.55 
 
 
221 aa  133  2e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0808304  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1096  CheW protein  35.47 
 
 
221 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.153582  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1306  CheW-like protein  40.09 
 
 
229 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1055  CheW protein  40.17 
 
 
227 aa  131  1e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1496  CheW domain protein  39.22 
 
 
229 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0830  CheW-like domain-containing protein  33.19 
 
 
217 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0258  CheW protein  27.45 
 
 
152 aa  56.2  5e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  5.34163e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0927  CheW protein  23.57 
 
 
157 aa  55.5  8e-07  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  26.81 
 
 
167 aa  53.5  3e-06  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  27.78 
 
 
158 aa  53.5  3e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  29.1 
 
 
189 aa  51.6  1e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  27 
 
 
141 aa  51.2  2e-05  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  25.58 
 
 
168 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  27.33 
 
 
168 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  23.97 
 
 
163 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  28.57 
 
 
162 aa  47  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  26.62 
 
 
152 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  26.49 
 
 
148 aa  47  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  26.49 
 
 
151 aa  47  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  26.62 
 
 
152 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  29.71 
 
 
155 aa  46.6  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  28.67 
 
 
167 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  26.24 
 
 
167 aa  46.2  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  28.37 
 
 
163 aa  45.8  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  23.87 
 
 
156 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  23.87 
 
 
156 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  27.66 
 
 
159 aa  45.8  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  29 
 
 
533 aa  45.4  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  26.95 
 
 
158 aa  45.4  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  28.93 
 
 
166 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  27.34 
 
 
158 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  26.24 
 
 
163 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  27.1 
 
 
159 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  27.54 
 
 
141 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  29.63 
 
 
139 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  25 
 
 
187 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  27.36 
 
 
141 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  27.61 
 
 
158 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  24.46 
 
 
302 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  26.28 
 
 
159 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  24.46 
 
 
302 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  24.26 
 
 
149 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  24.46 
 
 
302 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  24.46 
 
 
302 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  27.78 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  24.46 
 
 
302 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  23.74 
 
 
302 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  7.15462e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  27.4 
 
 
183 aa  43.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  28.36 
 
 
141 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  22.97 
 
 
154 aa  42.7  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  27.03 
 
 
165 aa  42.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4863e-14 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  23.74 
 
 
302 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  23.74 
 
 
302 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  23.74 
 
 
302 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  27.03 
 
 
165 aa  42.4  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  22.98 
 
 
187 aa  42.4  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  27.27 
 
 
165 aa  42  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  27.27 
 
 
165 aa  42  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46725e-13 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  28.38 
 
 
159 aa  42  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  26.62 
 
 
169 aa  42  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  26.81 
 
 
155 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  31.29 
 
 
212 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1843  CheW protein  30.23 
 
 
164 aa  42  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.718513  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  22.3 
 
 
154 aa  42  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>