70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1844 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1844  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  494  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  34.27 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  32.85 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  31.88 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  30.05 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  27.51 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  27.51 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  31.96 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  31.96 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  29.96 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  31.11 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  37.93 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  40 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  26.95 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  29.86 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  28.68 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2525  permease  26.21 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1991  hypothetical protein  36.84 
 
 		 121 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0197644  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  33.18 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  42.55 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  26.85 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  34.51 
 
 		 121 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  30.24 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  30.81 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  27.96 
 
 		 265 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6948  hypothetical protein  34.44 
 
 		 122 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0037  hypothetical protein  26.01 
 
 		 214 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0037  hypothetical protein  26.01 
 
 		 214 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  38.24 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2513  hypothetical protein  26.01 
 
 		 209 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.450854  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  28.57 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2432  hypothetical protein  23.79 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  29.19 
 
 		 254 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  30 
 
 		 260 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  30 
 
 		 260 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  27.43 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  29.84 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  50 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1785  hypothetical protein  37.93 
 
 		 121 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0399073 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  26.39 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2102  protein of unknown function DUF81  26.29 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.691582  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  31.4 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  24 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  26.57 
 
 		 298 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  27.62 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  30.22 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3317  hypothetical protein  23.08 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  30.42 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  30.31 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  28.95 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  29.2 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  30.43 
 
 		 117 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  27.86 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  29.18 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  43.5  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  29.29 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  23.57 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  27.64 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1348  hypothetical protein  27 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  27.8 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1843  permease  25.27 
 
 		 283 aa  42.7  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  29.88 
 
 		 266 aa  42.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  40 
 
 		 119 aa  42.4  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  27.27 
 
 		 123 aa  42.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2645  protein of unknown function DUF81  26.64 
 
 		 261 aa  42.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000890995  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  23.35 
 
 		 264 aa  42.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  31.74 
 
 		 264 aa  42  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  25.7 
 
 		 266 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  27.97 
 
 		 252 aa  42  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  31.74 
 
 		 268 aa  42  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>