259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1044 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1044  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  100 
 
 
232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.197981  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3540  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  69.06 
 
 
232 aa  320  9.000000000000001e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2128  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  70.14 
 
 
238 aa  319  3e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.303572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2044  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  70.14 
 
 
293 aa  318  3e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0668079  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0786  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  71.04 
 
 
241 aa  316  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543978  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0347  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  67.26 
 
 
231 aa  313  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.150562  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0683  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  68.75 
 
 
235 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4588  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  68.61 
 
 
235 aa  299  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.253572 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4325  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  68.16 
 
 
235 aa  296  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0387  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  56.6 
 
 
235 aa  238  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0433  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  56.13 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1799  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  53.33 
 
 
232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0131  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  55.61 
 
 
251 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.471911 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1520  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  52.44 
 
 
232 aa  230  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.634391 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0333  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  52.65 
 
 
235 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.44706  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0340  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  54.02 
 
 
237 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0196979  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4816  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  50.22 
 
 
236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1518  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  50.22 
 
 
232 aa  216  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438965 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1688  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  49.78 
 
 
240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0654719  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1862  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  50.22 
 
 
240 aa  215  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0932459  normal  0.0318257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1753  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  48.21 
 
 
230 aa  210  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0357  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  53.14 
 
 
234 aa  209  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101317  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2958  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  51.57 
 
 
244 aa  210  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0195  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  50 
 
 
243 aa  209  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2629  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  50 
 
 
236 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.168937 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2920  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  51.96 
 
 
230 aa  201  6e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4774  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  49.1 
 
 
229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.715033  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0129  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  48.89 
 
 
241 aa  178  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0638289  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2594  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  44.05 
 
 
234 aa  176  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3989  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.78 
 
 
229 aa  172  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1094  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.36 
 
 
242 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2353  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  44.1 
 
 
271 aa  170  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  46.67 
 
 
255 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0730  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.1 
 
 
234 aa  169  4e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000744541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1728  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.26 
 
 
245 aa  169  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.229172 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0072  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  46.22 
 
 
232 aa  168  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.109683  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11890  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  42.04 
 
 
236 aa  167  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000215744  normal  0.0186296 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0029  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.61 
 
 
244 aa  166  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0025  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.05 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1201  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.59 
 
 
236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1987  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.82 
 
 
245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3009  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.54 
 
 
234 aa  161  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00223674  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2066  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.67 
 
 
239 aa  159  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0034827  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3960  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.83 
 
 
234 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00328038  hitchhiker  0.000886746 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.8 
 
 
451 aa  157  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3908  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.83 
 
 
234 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1532  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.81 
 
 
236 aa  156  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0645  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.81 
 
 
236 aa  156  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2812  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.37 
 
 
232 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.902845  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2761  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.33 
 
 
277 aa  156  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1662  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.1 
 
 
241 aa  155  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000183413  hitchhiker  0.000549225 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02117  orotidine 5-phosphate decarboxylase  41.59 
 
 
232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000184829  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0060  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.97 
 
 
234 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.914028  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0054  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.2 
 
 
241 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.668833  normal  0.533949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4196  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.77 
 
 
244 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1501  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.54 
 
 
231 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199252  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0514  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  42.79 
 
 
243 aa  152  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.944181  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3220  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40 
 
 
235 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1736  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.41 
 
 
244 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000217643  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003024  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.91 
 
 
233 aa  150  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000599953  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4051  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.53 
 
 
232 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1417  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.95 
 
 
233 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.909746  normal  0.120698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1394  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.24 
 
 
233 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228607  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0684  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  37.82 
 
 
244 aa  148  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03614  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.11 
 
 
243 aa  147  9e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2664  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.24 
 
 
235 aa  148  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1815  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.24 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.253653  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3896  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.95 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0903268 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0923  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.72 
 
 
232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.881435  normal  0.442892 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1067  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.72 
 
 
232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1407  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.91 
 
 
235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.853895  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1676  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.2 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2569  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.4 
 
 
240 aa  146  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02856  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.16 
 
 
233 aa  146  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2441  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.86 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2068  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.36 
 
 
243 aa  145  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1299  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.4 
 
 
249 aa  145  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2463  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.77 
 
 
231 aa  145  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000296014  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1703  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.73 
 
 
243 aa  145  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00220988  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0792  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.29 
 
 
231 aa  144  8.000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1278  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  39.83 
 
 
239 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1376  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.74 
 
 
229 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1836  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.91 
 
 
244 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.533386  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2024  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.11 
 
 
245 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0902574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1913  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.11 
 
 
245 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268139  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1309  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.7 
 
 
246 aa  142  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.940136  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1380  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.28 
 
 
229 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1547  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.33 
 
 
241 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0883  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  38.12 
 
 
252 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1687  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.08 
 
 
245 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.660624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2640  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.77 
 
 
247 aa  142  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00027729  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2236  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.11 
 
 
245 aa  142  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00950632  hitchhiker  0.00992916 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1757  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.72 
 
 
231 aa  141  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0566904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26890  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.09 
 
 
232 aa  141  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.131013  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1031  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.97 
 
 
236 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0374618  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1866  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.05 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2278  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.66 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2155  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.6 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0463695  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2050  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.29 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  hitchhiker  0.000326951 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1328  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.48 
 
 
238 aa  139  6e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.104937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>