257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1094 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1094  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  100 
 
 
242 aa  482  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1987  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  64.98 
 
 
245 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0514  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  62.34 
 
 
243 aa  297  8e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.944181  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1728  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  57.02 
 
 
245 aa  252  5.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.229172 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1862  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  50.68 
 
 
240 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0932459  normal  0.0318257 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1688  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  49.77 
 
 
240 aa  194  8.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0654719  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0025  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.25 
 
 
244 aa  191  7e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0029  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.81 
 
 
244 aa  190  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0054  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  49.77 
 
 
241 aa  190  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.668833  normal  0.533949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0433  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  48.84 
 
 
235 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03614  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  48.4 
 
 
243 aa  186  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0387  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  48.37 
 
 
235 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0333  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  49.76 
 
 
235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.44706  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0131  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.45 
 
 
251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.471911 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4774  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  47.71 
 
 
229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.715033  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0340  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  49.29 
 
 
237 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0196979  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1799  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  47.79 
 
 
232 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1753  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  47.47 
 
 
230 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1518  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.58 
 
 
232 aa  175  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4816  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.76 
 
 
236 aa  174  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1520  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.78 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.634391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2629  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.3 
 
 
236 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.168937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0195  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  47.34 
 
 
243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1044  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.92 
 
 
232 aa  166  4e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.197981  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2128  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.85 
 
 
238 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.303572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2044  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.15 
 
 
293 aa  163  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0668079  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.35 
 
 
255 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2958  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.93 
 
 
244 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0786  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.77 
 
 
241 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543978  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2568  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.09 
 
 
249 aa  156  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000104068  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3540  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.09 
 
 
232 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3989  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.05 
 
 
229 aa  156  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0683  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.7 
 
 
235 aa  155  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0347  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.79 
 
 
231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.150562  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0072  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.25 
 
 
232 aa  154  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.109683  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2920  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  42.23 
 
 
230 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2761  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.61 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2066  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.67 
 
 
239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0034827  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0129  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.64 
 
 
241 aa  151  8.999999999999999e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0638289  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2353  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  40.69 
 
 
271 aa  149  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0923  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.06 
 
 
232 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.881435  normal  0.442892 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1067  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.06 
 
 
232 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0730  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.63 
 
 
234 aa  149  5e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000744541 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0924  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.08 
 
 
238 aa  148  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4588  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.91 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.253572 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0883  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  42.6 
 
 
252 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4325  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.37 
 
 
235 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0357  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  46.41 
 
 
234 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101317  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2664  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.29 
 
 
235 aa  146  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1866  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40 
 
 
241 aa  146  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2812  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.48 
 
 
232 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.902845  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2068  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.24 
 
 
243 aa  145  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2594  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  41.63 
 
 
234 aa  144  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4051  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.03 
 
 
232 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.91 
 
 
451 aa  143  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1547  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.98 
 
 
241 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1687  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.65 
 
 
245 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.660624  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3908  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.46 
 
 
234 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0060  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.9 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.914028  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3960  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.46 
 
 
234 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00328038  hitchhiker  0.000886746 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2569  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.92 
 
 
240 aa  138  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2349  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.91 
 
 
237 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.872566 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0980  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.55 
 
 
231 aa  137  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0327269  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1299  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.91 
 
 
249 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0645  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.5 
 
 
236 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1532  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.5 
 
 
236 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1724  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.44 
 
 
227 aa  136  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.297453  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1571  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.6 
 
 
244 aa  135  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0574999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1335  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37 
 
 
240 aa  135  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000805853 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1407  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.22 
 
 
235 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.853895  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1376  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.79 
 
 
229 aa  135  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0376  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.15 
 
 
239 aa  135  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2797  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.67 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.212231  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1461  orotidine 5`-phosphate decarboxylase  38.33 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190153  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1380  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.36 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0446  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.71 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733361  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1417  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.36 
 
 
233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.909746  normal  0.120698 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1047  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.87 
 
 
233 aa  133  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.176456  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4196  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.27 
 
 
244 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2890  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.12 
 
 
240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1815  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.67 
 
 
233 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.253653  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1394  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.67 
 
 
233 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228607  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3896  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.67 
 
 
233 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0903268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4089  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  41.26 
 
 
226 aa  131  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.691507  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1201  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.84 
 
 
236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11890  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  38.79 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000215744  normal  0.0186296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3861  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.2 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.774013  normal  0.0672565 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1468  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.73 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.522803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1676  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.91 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15141  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.62 
 
 
242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.463498  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3009  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00223674  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2278  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.71 
 
 
232 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2315  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.34 
 
 
233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0273911  hitchhiker  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3220  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.56 
 
 
235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02856  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.99 
 
 
233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1501  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.07 
 
 
231 aa  129  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199252  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003024  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.61 
 
 
233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000599953  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15281  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.62 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2681  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.13 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26890  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.71 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.131013  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>