297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_04148 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00482  predicted outer membrane export usher protein  47.15 
 
 		 869 aa  810    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00944  predicted outer membrane usher protein  48.89 
 
 		 866 aa  818    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.887822  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00487  hypothetical protein  47.15 
 
 		 869 aa  810    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1666  fimbrial usher family protein  57.54 
 
 		 871 aa  1036    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504139 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  100 
 
 		 878 aa  1813    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2179  outer membrane usher protein fimD-like protein  48.77 
 
 		 866 aa  816    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.932643  normal  0.834799 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00951  hypothetical protein  48.89 
 
 		 866 aa  818    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.90606  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2703  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  48.89 
 
 		 866 aa  819    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0538339  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3081  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  46.98 
 
 		 867 aa  797    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  99.89 
 
 		 878 aa  1810    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1049  outer membrane usher protein fimD-like protein  48.66 
 
 		 866 aa  811    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.607471  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0026  outer membrane usher protein FimD  51.83 
 
 		 888 aa  837    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  47.52 
 
 		 870 aa  804    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0656  outer membrane usher protein SfmD  47.52 
 
 		 870 aa  806    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1055  outer membrane usher protein fimD  49.01 
 
 		 866 aa  820    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  99.43 
 
 		 878 aa  1803    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  47.92 
 
 		 876 aa  806    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  98.84 
 
 		 863 aa  1765    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  47.4 
 
 		 870 aa  804    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2377  outer membrane usher protein fimD homolog  48.89 
 
 		 866 aa  817    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108506  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3960  outer membrane usher protein FimD  43.79 
 
 		 842 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  98.6 
 
 		 856 aa  1746    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  47.4 
 
 		 870 aa  804    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.053453 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0599  fimbrial usher protein  47.4 
 
 		 870 aa  802    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0484781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3851  outer membrane usher protein FimD  43.79 
 
 		 842 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0026  outer membrane usher protein FimD  51.71 
 
 		 888 aa  833    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0792355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0607  outer membrane usher protein fimD  46.81 
 
 		 869 aa  800    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0594926  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0024  outer membrane usher protein FimD  51.83 
 
 		 873 aa  836    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.267854  normal  0.163844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  43.68 
 
 		 842 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.834184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3090  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  47.04 
 
 		 869 aa  806    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.832581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  100 
 
 		 878 aa  1813    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.5 
 
 		 837 aa  653    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0577  outer membrane usher protein SfmD  47.15 
 
 		 869 aa  804    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.5582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  48.64 
 
 		 833 aa  806    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  52.06 
 
 		 877 aa  875    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0025  outer membrane usher protein FimD  51.83 
 
 		 888 aa  836    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.028823  normal  0.118886 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0025  outer membrane usher protein FimD  51.83 
 
 		 888 aa  837    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0588197  normal  0.0296149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.71 
 
 		 840 aa  645    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2118  fimbrial usher family protein  60.98 
 
 		 740 aa  954    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.167309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0633  outer membrane usher protein SfmD  47.04 
 
 		 869 aa  805    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.770244  normal  0.392496 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  41.84 
 
 		 851 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.396185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  39.28 
 
 		 840 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118889 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  39.4 
 
 		 839 aa  602  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5161  fimbrial usher protein  37.87 
 
 		 844 aa  589  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.711297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1521  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.74 
 
 		 871 aa  588  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.911092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4914  outer membrane usher protein FimD, truncation  99.3 
 
 		 286 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0191  outer membrane usher protein FimD  38.68 
 
 		 848 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0207  outer membrane usher protein FimD  38.68 
 
 		 848 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0199  outer membrane usher protein FimD  38.68 
 
 		 848 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.548141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0190  outer membrane usher protein FimD  38.68 
 
 		 848 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.536682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0194  outer membrane usher protein FimD  38.95 
 
 		 848 aa  575  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.931496 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  39.69 
 
 		 809 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  39.88 
 
 		 809 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  39.69 
 
 		 809 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  39.69 
 
 		 809 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.39 
 
 		 851 aa  570  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  39.76 
 
 		 809 aa  569  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  37.87 
 
 		 863 aa  555  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  37.41 
 
 		 838 aa  551  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  37.41 
 
 		 838 aa  551  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.64 
 
 		 838 aa  552  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  37.64 
 
 		 838 aa  550  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  37.76 
 
 		 838 aa  552  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.19 
 
 		 838 aa  546  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.3 
 
 		 859 aa  535  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.98 
 
 		 861 aa  520  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.69 
 
 		 880 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  36.7 
 
 		 901 aa  503  1e-141  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.7 
 
 		 901 aa  503  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0331  outer-membrane fimbrial usher protein  36.41 
 
 		 836 aa  502  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  36.27 
 
 		 836 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0185038 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  36.27 
 
 		 850 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.15 
 
 		 844 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  36.15 
 
 		 833 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  36.64 
 
 		 836 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.25 
 
 		 850 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  36.03 
 
 		 833 aa  492  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  35.92 
 
 		 833 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0330  outer-membrane fimbrial usher protein  36.29 
 
 		 836 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.428849  normal  0.361792 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.24 
 
 		 886 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.17 
 
 		 867 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.2 
 
 		 866 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  34.22 
 
 		 839 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4405  usher CupC3  35.31 
 
 		 839 aa  479  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.57 
 
 		 884 aa  479  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.36 
 
 		 1040 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.63 
 
 		 930 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2757  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.31 
 
 		 823 aa  476  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2676  fimbrial usher protein  36.43 
 
 		 823 aa  469  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.529958  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  35.76 
 
 		 939 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1531  outer membrane usher protein PsaC precursor  36.43 
 
 		 823 aa  469  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00459102  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3924  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.04 
 
 		 875 aa  466  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215778  normal  0.607518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.18 
 
 		 872 aa  466  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  34.98 
 
 		 913 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3811  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.04 
 
 		 875 aa  466  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647139  normal  0.153634 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  34.98 
 
 		 914 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01463  hypothetical protein  56.81 
 
 		 382 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.559549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2141  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  56.81 
 
 		 382 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000830223  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1589  fimbrial usher family protein  56.81 
 
 		 382 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0838  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.52 
 
 		 852 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>