More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_14750 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_14750  Biopolymer transport protein ExbD  100 
 
 
142 aa  285  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1613  biopolymer transport protein ExbD/TolR  80.99 
 
 
142 aa  236  9e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.921592  normal  0.194939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4176  biopolymer transport protein ExbD/TolR  70.29 
 
 
142 aa  202  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0268987  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3846  biopolymer transport protein ExbD/TolR family  69.72 
 
 
143 aa  200  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.661546  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1634  biopolymer transport protein ExbD/TolR  69.01 
 
 
143 aa  200  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0335583  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  68.42 
 
 
146 aa  180  5e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25500  hypothetical protein  68.42 
 
 
146 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.236019  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1510  biopolymer transport protein ExbD/TolR  71.22 
 
 
144 aa  156  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43562  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1899  biopolymer transport protein ExbD/TolR  69.78 
 
 
144 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  5.11207e-05 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  69.06 
 
 
144 aa  151  3e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0605408  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3815  biopolymer transport protein ExbD/TolR  69.06 
 
 
144 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446813  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.11 
 
 
141 aa  139  1e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.1 
 
 
140 aa  128  2e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.51 
 
 
140 aa  119  2e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.72 
 
 
137 aa  115  2e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2060  GTP cyclohydrolase I  42.55 
 
 
143 aa  114  4e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.45 
 
 
140 aa  110  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0632  biopolymer ExbD/TolR family transporter  39.44 
 
 
141 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  41.35 
 
 
154 aa  103  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.85 
 
 
141 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.74 
 
 
140 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  40.32 
 
 
145 aa  100  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.32 
 
 
145 aa  100  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2529  biopolymer transport EXBD-like transmembrane protein  42.76 
 
 
143 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.161438  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.94 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.58 
 
 
142 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.86 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0584856  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2554  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.43 
 
 
141 aa  92  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133317 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2091  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.51 
 
 
140 aa  92  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0833564  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4892  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.56 
 
 
144 aa  91.3  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.310639 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1509  biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  37.5 
 
 
138 aa  90.1  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.171101  normal  0.278773 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3216  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.13 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300081  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2642  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.35 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1317  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.97 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.893415  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0536  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.13 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  1.96939e-07  hitchhiker  9.05807e-07 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.97 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.09 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.37129e-08  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  3.95657e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2565  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  hitchhiker  0.00490818 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2484  putative biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  35.97 
 
 
147 aa  83.6  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0200822  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.82 
 
 
134 aa  82.4  2e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1555  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.81 
 
 
141 aa  82.4  2e-15  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2304  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.81 
 
 
141 aa  82.4  2e-15  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0677093  normal  0.134165 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  33.82 
 
 
134 aa  82.4  2e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1028  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.62 
 
 
138 aa  81.3  4e-15  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  3.74903e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0285  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.61 
 
 
149 aa  80.9  5e-15  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2948  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.59 
 
 
142 aa  80.5  8e-15  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3571  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.59 
 
 
141 aa  80.1  9e-15  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161015  decreased coverage  0.00354496 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.37 
 
 
142 aa  79.7  1e-14  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.56 
 
 
132 aa  79  2e-14  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0313  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.65 
 
 
158 aa  73.9  6e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1924  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.11 
 
 
144 aa  72.4  2e-12  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.58 
 
 
143 aa  69.7  1e-11  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  34.53 
 
 
136 aa  69.7  1e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.78844e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.35 
 
 
134 aa  68.9  2e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.85 
 
 
138 aa  68.2  4e-11  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2155  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 
134 aa  65.5  3e-10  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0455  biopolymer transport protein (ExbD2)  29.58 
 
 
134 aa  65.1  3e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0057258  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.22 
 
 
136 aa  64.3  5e-10  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  34.78 
 
 
135 aa  63.9  7e-10  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  1.82227e-06 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.4 
 
 
142 aa  63.5  9e-10  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0453  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.25 
 
 
134 aa  62.8  1e-09  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00775346  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.91 
 
 
133 aa  62.4  2e-09  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1847  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.33 
 
 
130 aa  62.8  2e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.730316  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  31.54 
 
 
136 aa  62.8  2e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
139 aa  61.2  4e-09  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0915  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.16 
 
 
140 aa  60.8  6e-09  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.574244  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4069  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.1 
 
 
135 aa  59.7  1e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  31.25 
 
 
134 aa  59.7  1e-08  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2417  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.09 
 
 
133 aa  59.7  1e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.978308  normal  0.103563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  30.3 
 
 
133 aa  59.7  1e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  31.45 
 
 
134 aa  59.3  2e-08  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.6 
 
 
136 aa  59.3  2e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  30.71 
 
 
140 aa  59.3  2e-08  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  31.45 
 
 
134 aa  59.3  2e-08  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.77 
 
 
136 aa  58.5  3e-08  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000845  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.07 
 
 
134 aa  58.5  3e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.63 
 
 
134 aa  58.5  3e-08  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.13 
 
 
133 aa  58.2  4e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.62 
 
 
144 aa  57.8  5e-08  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.01992e-05  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0438  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.62 
 
 
137 aa  57.8  5e-08  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.744335  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.62 
 
 
144 aa  57.8  5e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  4.32796e-06  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  32.8 
 
 
139 aa  57.8  5e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  30.66 
 
 
138 aa  57.4  6e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.06 
 
 
141 aa  57.4  6e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.13 
 
 
135 aa  57.4  7e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0546  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.14 
 
 
152 aa  57.4  7e-08  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00922706  normal  0.113975 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1866  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.53 
 
 
142 aa  56.2  1e-07  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.838345 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.63 
 
 
131 aa  57  1e-07  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.65 
 
 
137 aa  56.6  1e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.34 
 
 
133 aa  57  1e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.23 
 
 
136 aa  55.8  2e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  32.23 
 
 
144 aa  55.5  2e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  4.3737e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.19 
 
 
134 aa  55.8  2e-07  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  4.57301e-05 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3905  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.33 
 
 
133 aa  55.5  2e-07  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.396754  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.23 
 
 
144 aa  55.8  2e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.76409e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  29.46 
 
 
134 aa  55.8  2e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  32.23 
 
 
144 aa  55.8  2e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.88711e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2158  TonB system transport protein ExbD  30.77 
 
 
131 aa  55.5  2e-07  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5124  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.12 
 
 
141 aa  55.5  2e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>