More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0427 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0427  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 354 aa  730    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522536  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  85.31 
 
 		 354 aa  637    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  hitchhiker  0.0000206811 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0026  tryptophanyl-tRNA synthetase  86.4 
 
 		 354 aa  627  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606354  normal  0.463115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  85.55 
 
 		 354 aa  620  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0701529  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4035  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.94 
 
 		 355 aa  557  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0155  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.75 
 
 		 355 aa  539  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.19 
 
 		 355 aa  532  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0136  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.19 
 
 		 355 aa  532  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748713  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5332  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.58 
 
 		 354 aa  508  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2568  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.8 
 
 		 344 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184984 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0370  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.86 
 
 		 353 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.58 
 
 		 353 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.23 
 
 		 348 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0338  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.58 
 
 		 353 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0583  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.66 
 
 		 350 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3085  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.48 
 
 		 345 aa  494  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3413  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.01 
 
 		 347 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4409  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.73 
 
 		 347 aa  488  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.38 
 
 		 349 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.2 
 
 		 350 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0360  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.1 
 
 		 344 aa  479  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.24 
 
 		 350 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0216  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.24 
 
 		 347 aa  477  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.72 
 
 		 335 aa  477  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.96 
 
 		 347 aa  475  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0108214  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1167  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.41 
 
 		 356 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.98 
 
 		 332 aa  454  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0455  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.36 
 
 		 357 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1808  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.36 
 
 		 357 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.52 
 
 		 342 aa  440  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0466  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.51 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.21086 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.52 
 
 		 345 aa  432  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.6 
 
 		 341 aa  429  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.11 
 
 		 341 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.97 
 
 		 344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3953  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 		 339 aa  403  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0672671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0082  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 331 aa  393  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141856  normal  0.0206333 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 339 aa  388  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.05 
 
 		 331 aa  391  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1020  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 333 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2013  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.44 
 
 		 332 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0126369 
 
 
-
 
NC_002978  WD0801  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 332 aa  318  9e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.154827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 355 aa  310  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 		 336 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 		 336 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 336 aa  308  8e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 335 aa  305  6e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  47.28 
 
 		 342 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 337 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 332 aa  293  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 332 aa  293  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 339 aa  292  6e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 332 aa  292  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 365 aa  290  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 332 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 339 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502429 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 334 aa  289  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 334 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 334 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 332 aa  289  6e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10521  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 337 aa  289  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.167395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 332 aa  288  7e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 332 aa  288  8e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 337 aa  288  1e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 332 aa  287  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4670  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 		 335 aa  283  2.0000000000000002e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.406133  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3360  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18651  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 338 aa  282  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06631  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 347 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0266  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456262  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 338 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 328 aa  279  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 338 aa  278  8e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 330 aa  278  8e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0348  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 335 aa  278  8e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 337 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.852523  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4257  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 335 aa  276  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294699 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15595  predicted protein  44.2 
 
 		 360 aa  276  3e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4105  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 332 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4075  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 332 aa  276  6e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0390  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 340 aa  275  7e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0168  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 333 aa  275  9e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3753  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3849  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3995  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00082  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 345 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3787  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3680  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.408983  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3678  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>