More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3150 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  73.48 
 
 
573 aa  847  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  66.46 
 
 
508 aa  689  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  60.28 
 
 
512 aa  639  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  64.87 
 
 
513 aa  675  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 
502 aa  687  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  77.22 
 
 
504 aa  803  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
561 aa  1147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  64.87 
 
 
513 aa  677  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  74.01 
 
 
573 aa  853  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  77.98 
 
 
509 aa  805  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  76.7 
 
 
573 aa  891  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  66.06 
 
 
502 aa  692  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  64.59 
 
 
503 aa  685  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  58.92 
 
 
512 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  60.33 
 
 
488 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32202  predicted protein  61.99 
 
 
485 aa  624  1e-177  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.334711  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  59.12 
 
 
512 aa  621  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50879  predicted protein  57.6 
 
 
607 aa  597  1e-169  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  57.06 
 
 
510 aa  575  1e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  1.27982e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 
497 aa  560  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  8.63751e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  55.4 
 
 
489 aa  560  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  1.6249e-11  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  54.89 
 
 
494 aa  552  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 
494 aa  548  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 
491 aa  545  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.53681e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 
488 aa  548  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.42799e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  54.44 
 
 
493 aa  543  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  56.57 
 
 
489 aa  543  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 
495 aa  543  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  1.64497e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 
499 aa  539  1e-152  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  2.60184e-08  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  54.4 
 
 
499 aa  535  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 
489 aa  530  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  3.38438e-06  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 
509 aa  528  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 
515 aa  528  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  53.12 
 
 
499 aa  525  1e-148  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  8.7404e-10 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 
503 aa  525  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 
515 aa  528  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 
495 aa  522  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 
501 aa  524  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 
501 aa  524  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 
490 aa  522  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  2.75305e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  52.52 
 
 
647 aa  516  1e-145  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  9.3194e-05  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
499 aa  516  1e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  7.14975e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 
499 aa  514  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
499 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.36352e-10 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
499 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
499 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
499 aa  510  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
499 aa  510  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 
523 aa  510  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
499 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
499 aa  510  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 
508 aa  508  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
499 aa  508  1e-142  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
499 aa  506  1e-142  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  3.41012e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  52.15 
 
 
491 aa  507  1e-142  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 
496 aa  506  1e-142  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
499 aa  508  1e-142  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  1.72197e-09 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  53.74 
 
 
497 aa  506  1e-142  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 
494 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  8.657e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 
492 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 
494 aa  499  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 
494 aa  495  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 
492 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 
502 aa  498  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  3.93607e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 
502 aa  498  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 
514 aa  495  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 
492 aa  497  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 
505 aa  496  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  50.6 
 
 
498 aa  497  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 
496 aa  492  1e-138  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 
491 aa  493  1e-138  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
508 aa  493  1e-138  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  5.49631e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
502 aa  493  1e-138  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 
507 aa  493  1e-138  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 
503 aa  494  1e-138  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1667  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 
515 aa  493  1e-138  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208313  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 
496 aa  493  1e-138  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 
496 aa  492  1e-138  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
505 aa  489  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
498 aa  488  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
505 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
631 aa  491  1e-137  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
505 aa  488  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 
489 aa  491  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  3.78083e-06 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0406  lysyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 
495 aa  491  1e-137  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
489 aa  491  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
505 aa  488  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2116  lysyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 
511 aa  489  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  48.83 
 
 
505 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
505 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  48.83 
 
 
505 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 
494 aa  491  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
505 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
505 aa  487  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1206  lysyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 
513 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
505 aa  487  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
505 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 
508 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 
505 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 
508 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>