More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1960 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  100 
 
 
333 aa  684    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  57.33 
 
 
339 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  37.45 
 
 
306 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  37.45 
 
 
306 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  42.42 
 
 
282 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  32.08 
 
 
347 aa  149  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1467  peptidase M28  35.02 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  33.33 
 
 
335 aa  142  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  34.51 
 
 
308 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2718  peptidase M28  52.52 
 
 
138 aa  126  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1307  peptidase M28  32.71 
 
 
299 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0681394  normal  0.0392161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2428  M28 family peptidase  32.1 
 
 
273 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  33.2 
 
 
323 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2420  M28A family peptidase  33.2 
 
 
323 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.564351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3011  peptidase M28  28.57 
 
 
325 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844179  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3053  peptidase M28  28.57 
 
 
325 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.387481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3438  peptidase M28  29.13 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.346638  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3437  peptidase M28  28.41 
 
 
453 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  31.91 
 
 
450 aa  85.9  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  44.44 
 
 
465 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  32.71 
 
 
775 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  43.43 
 
 
466 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  33.33 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  27.57 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  42.42 
 
 
466 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  42.42 
 
 
466 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  42.42 
 
 
466 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  42.42 
 
 
466 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  42.42 
 
 
466 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  42.42 
 
 
466 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  42.42 
 
 
466 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  28.11 
 
 
947 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  42.42 
 
 
466 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  42.42 
 
 
466 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  29.29 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0187  peptidase M28  26.63 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  30.9 
 
 
584 aa  77  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  35.19 
 
 
502 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  28.98 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  29.07 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  35.71 
 
 
574 aa  73.6  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4339  peptidase M28  42.86 
 
 
815 aa  72.8  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  29.04 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  33.9 
 
 
625 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  28.24 
 
 
534 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  36.79 
 
 
457 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  27.15 
 
 
548 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  28.36 
 
 
512 aa  70.9  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3936  peptidase M28  45.65 
 
 
616 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  39.22 
 
 
512 aa  69.7  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  28.11 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  28.38 
 
 
518 aa  69.3  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  28.46 
 
 
502 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  30.09 
 
 
490 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  24.54 
 
 
568 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0003  peptidase M28  23.42 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  26.5 
 
 
1131 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  28.35 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  28.37 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  40.23 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2824  peptidase M28  31.47 
 
 
771 aa  66.6  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264014  normal  0.0144765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  29.61 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  28.25 
 
 
524 aa  66.2  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  27.62 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  25.61 
 
 
457 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  29.07 
 
 
535 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  29.07 
 
 
536 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28372  leucyl aminopeptidase precursor  26.13 
 
 
407 aa  65.9  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.36652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  28.94 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  25.33 
 
 
1147 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  31.21 
 
 
424 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  37.3 
 
 
518 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  42 
 
 
647 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  29.36 
 
 
488 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  31.11 
 
 
437 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  34.38 
 
 
1247 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  29.93 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  42.86 
 
 
647 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04750  peptidase, M20/M25/M40 family protein  32.37 
 
 
783 aa  64.7  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  29.93 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1190  peptidase M28  31.09 
 
 
629 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.909659  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  27.8 
 
 
513 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  43.01 
 
 
346 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  28.37 
 
 
455 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  37.4 
 
 
501 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  37.4 
 
 
501 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  28.96 
 
 
313 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4460  aminopeptidase  29.58 
 
 
794 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000347887  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  37.4 
 
 
501 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  22.97 
 
 
462 aa  63.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  27.84 
 
 
325 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0544  aminopeptidase Y  26.36 
 
 
479 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.282981  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  38.46 
 
 
539 aa  63.5  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2998  peptidase M28  36.61 
 
 
778 aa  63.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0554  aminopeptidase Y  26.5 
 
 
479 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0566  aminopeptidase Y  26.5 
 
 
479 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  25.39 
 
 
1077 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  29.48 
 
 
398 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  29.29 
 
 
1103 aa  63.2  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  28.44 
 
 
500 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>