50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3569 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  100 
 
 
163 aa  332  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  69.38 
 
 
162 aa  221  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  55.21 
 
 
163 aa  169  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  54.9 
 
 
157 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  54.9 
 
 
157 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  54.9 
 
 
157 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  53.21 
 
 
165 aa  160  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  52.15 
 
 
163 aa  159  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  56.25 
 
 
154 aa  152  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  56.38 
 
 
154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  52.74 
 
 
154 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  51.33 
 
 
166 aa  147  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 
160 aa  147  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  50.98 
 
 
153 aa  147  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  47.13 
 
 
174 aa  140  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  49.35 
 
 
162 aa  140  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  48.37 
 
 
153 aa  139  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  50.31 
 
 
168 aa  139  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  46.41 
 
 
155 aa  137  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 
152 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 
160 aa  133  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  48.37 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  46.45 
 
 
154 aa  130  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  48.65 
 
 
155 aa  130  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  44.87 
 
 
155 aa  128  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  50 
 
 
154 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  48.32 
 
 
155 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  50 
 
 
166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  46.2 
 
 
155 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 
164 aa  124  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  44 
 
 
172 aa  124  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 
156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
324 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 
162 aa  84.7  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  35 
 
 
160 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  34 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  34 
 
 
157 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  34 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  34 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  30.77 
 
 
160 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  30.77 
 
 
160 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
139 aa  44.3  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 
156 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 
156 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  33.68 
 
 
158 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
138 aa  40.8  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1870  NUDIX hydrolase  27 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0662124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>