142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0722 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  100 
 
 
240 aa  479  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  36.44 
 
 
240 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  36.32 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  36 
 
 
228 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  35.27 
 
 
228 aa  128  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  30.53 
 
 
225 aa  125  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  33.79 
 
 
225 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  31.44 
 
 
229 aa  123  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  29.69 
 
 
235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  30.53 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  26.22 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  28.02 
 
 
238 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  29.39 
 
 
232 aa  101  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  27.56 
 
 
229 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  27.56 
 
 
229 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  29.49 
 
 
226 aa  98.2  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  28.25 
 
 
229 aa  92.4  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  29.17 
 
 
227 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  26.22 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  26.05 
 
 
230 aa  85.5  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  26.64 
 
 
230 aa  85.5  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  25.44 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  25.97 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  25.85 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  26.22 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2456  urease accessory protein UreF  26.78 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  26.61 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  27.56 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  25.59 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  26.46 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  25.75 
 
 
226 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  26.61 
 
 
226 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  26.61 
 
 
226 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  24.27 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  23.11 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  27.19 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  21.66 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  25.76 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  25.75 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  25.32 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  25.22 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  26.64 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  26.18 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  23.85 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  26.01 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  25.11 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  25.33 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  24.89 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  26.36 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  20.89 
 
 
227 aa  72  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2009  Urease accessory protein UreF  27.43 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  25.22 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  24.89 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  25.35 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  24 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  25.76 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  23.68 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2716  urease accessory protein UreF  25.91 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  23.31 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3468  urease accessory protein UreF  24.23 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000115011  normal  0.208076 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  27.51 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  22.79 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00891  Urease accessory protein UreF  24.41 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42714  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  24.68 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2262  urease accessory protein UreF  26.41 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  23.42 
 
 
243 aa  65.1  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  22.47 
 
 
237 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  23.58 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  23.73 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0984  urease accessory protein UreF  23.72 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.341569  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  25.75 
 
 
232 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4214  urease accessory protein UreF  24.56 
 
 
247 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  22.94 
 
 
224 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2199  urease accessory protein UreF  23.43 
 
 
243 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0590668  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  21.83 
 
 
232 aa  62.4  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  24.55 
 
 
240 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1960  putative urease accessory protein UreF  22.97 
 
 
223 aa  62  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  20.61 
 
 
224 aa  62  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0061  Urease accessory protein UreF  22.71 
 
 
239 aa  62  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  22.71 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  24.45 
 
 
214 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  20.47 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  21.99 
 
 
238 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  21.72 
 
 
241 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  22.41 
 
 
244 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  22.91 
 
 
223 aa  59.3  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1681  urease accessory protein UreF  24.11 
 
 
231 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591777  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4444  urease accessory protein UreF  20.8 
 
 
225 aa  58.5  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.8214 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  22.13 
 
 
288 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  25 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5615  urease accessory protein UreF  22.37 
 
 
223 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  24.03 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2412  urease accessory protein UreF  24.36 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>