61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2412 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2412  urease accessory protein UreF  100 
 
 		 243 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2199  urease accessory protein UreF  85.6 
 
 		 243 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0590668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1195  urease accessory protein UreF  45.61 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6191  urease accessory protein UreF  40.98 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00827459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1355  Urease accessory protein UreF  45.19 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1960  putative urease accessory protein UreF  39.17 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1134  Urease accessory protein UreF  43.51 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4444  urease accessory protein UreF  39.09 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.8214 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  32.81 
 
 		 266 aa  105  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  28.69 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  28.29 
 
 		 232 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0061  Urease accessory protein UreF  33.06 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  31.54 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1681  urease accessory protein UreF  30.77 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  27.54 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  27.43 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5118  Urease accessory protein UreF  28.69 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  25.53 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  26.58 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  26.58 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  24.18 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  24.18 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  24.18 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2716  urease accessory protein UreF  28.88 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0974  hypothetical protein  36 
 
 		 218 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  23.08 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  24.9 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  29.2 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  33.2 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  23.87 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  24.79 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  24.79 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2064  Urease accessory protein UreF  34.78 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000168254  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  31.6 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  37.11 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  27.85 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  27.19 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  26.21 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  30.38 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  36.08 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  23.41 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  29.92 
 
 		 227 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  27.56 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  29.61 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  30.34 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  24.03 
 
 		 225 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  25.99 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  32.86 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6442  putative urease accessory protein  30 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0548041  normal  0.22219 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2009  Urease accessory protein UreF  40.54 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  20.97 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  27.45 
 
 		 223 aa  45.8  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  24.05 
 
 		 229 aa  45.4  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  28.05 
 
 		 230 aa  45.4  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0885  urease accessory protein UreF  21.76 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  24.9 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  26.14 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3047  Urease accessory protein UreF  31.33 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  24.8 
 
 		 224 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  26.86 
 
 		 229 aa  42.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3260  urease accessory protein UreF  40.58 
 
 		 228 aa  42  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>